Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0E3

Lysmd1, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd1Q9D0E3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Lysmd1Q9D0E3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lysmd1Q9D0E3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lysmd1Q9D0E3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lysmd1Q9D0E3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lysmd1Q9D0E3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lysmd1Q9D0E3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lysmd1Q9D0E3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lysmd1Q9D0E3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lysmd1Q9D0E3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Lysmd1Q9D0E3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Lysmd1Q9D0E3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lysmd1Q9D0E3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lysmd1Q9D0E3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lysmd1Q9D0E3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lysmd1Q9D0E3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lysmd1Q9D0E3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lysmd1Q9D0E3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lysmd1Q9D0E3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lysmd1Q9D0E3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lysmd1Q9D0E3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lysmd1Q9D0E3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lysmd1Q9D0E3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lysmd1Q9D0E3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Lysmd1Q9D0E3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Lysmd1Q9D0E3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Lysmd1Q9D0E3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lysmd1Q9D0E3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lysmd1Q9D0E3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lysmd1Q9D0E3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lysmd1Q9D0E3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lysmd1Q9D0E3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lysmd1Q9D0E3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lysmd1Q9D0E3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lysmd1Q9D0E3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lysmd1Q9D0E3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lysmd1Q9D0E3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lysmd1Q9D0E3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lysmd1Q9D0E3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lysmd1Q9D0E3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lysmd1Q9D0E3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lysmd1Q9D0E3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Lysmd1Q9D0E3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lysmd1Q9D0E3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lysmd1Q9D0E3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lysmd1Q9D0E3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lysmd1Q9D0E3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lysmd1Q9D0E3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lysmd1Q9D0E3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lysmd1Q9D0E3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lysmd1Q9D0E3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lysmd1Q9D0E3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lysmd1Q9D0E3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lysmd1Q9D0E3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lysmd1Q9D0E3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lysmd1Q9D0E3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lysmd1Q9D0E3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lysmd1Q9D0E3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lysmd1Q9D0E3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Lysmd1Q9D0E3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lysmd1Q9D0E3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lysmd1Q9D0E3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lysmd1Q9D0E3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lysmd1Q9D0E3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lysmd1Q9D0E3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lysmd1Q9D0E3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lysmd1Q9D0E3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lysmd1Q9D0E3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lysmd1Q9D0E3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lysmd1Q9D0E3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lysmd1Q9D0E3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lysmd1Q9D0E3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lysmd1Q9D0E3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lysmd1Q9D0E3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lysmd1Q9D0E3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lysmd1Q9D0E3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lysmd1Q9D0E3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lysmd1Q9D0E3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lysmd1Q9D0E3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lysmd1Q9D0E3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lysmd1Q9D0E3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lysmd1Q9D0E3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lysmd1Q9D0E3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lysmd1Q9D0E3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lysmd1Q9D0E3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lysmd1Q9D0E3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lysmd1Q9D0E3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lysmd1Q9D0E3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lysmd1Q9D0E3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lysmd1Q9D0E3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lysmd1Q9D0E3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lysmd1Q9D0E3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lysmd1Q9D0E3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lysmd1Q9D0E3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lysmd1Q9D0E3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lysmd1Q9D0E3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lysmd1Q9D0E3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lysmd1Q9D0E3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lysmd1Q9D0E3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lysmd1Q9D0E3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.1 ms