Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Thumpd2Q9CZB3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Thumpd2Q9CZB3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Thumpd2Q9CZB3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Thumpd2Q9CZB3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Thumpd2Q9CZB3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Thumpd2Q9CZB3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Thumpd2Q9CZB3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Thumpd2Q9CZB3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Thumpd2Q9CZB3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Thumpd2Q9CZB3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Thumpd2Q9CZB3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Thumpd2Q9CZB3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Thumpd2Q9CZB3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Thumpd2Q9CZB3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Thumpd2Q9CZB3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Thumpd2Q9CZB3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Thumpd2Q9CZB3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Thumpd2Q9CZB3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Thumpd2Q9CZB3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Thumpd2Q9CZB3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Thumpd2Q9CZB3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Thumpd2Q9CZB3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Thumpd2Q9CZB3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Thumpd2Q9CZB3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Thumpd2Q9CZB3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Thumpd2Q9CZB3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Thumpd2Q9CZB3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Thumpd2Q9CZB3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Thumpd2Q9CZB3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Thumpd2Q9CZB3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Thumpd2Q9CZB3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Thumpd2Q9CZB3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Thumpd2Q9CZB3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Thumpd2Q9CZB3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Thumpd2Q9CZB3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Thumpd2Q9CZB3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Thumpd2Q9CZB3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Thumpd2Q9CZB3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Thumpd2Q9CZB3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Thumpd2Q9CZB3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Thumpd2Q9CZB3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Thumpd2Q9CZB3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Thumpd2Q9CZB3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Thumpd2Q9CZB3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Thumpd2Q9CZB3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Thumpd2Q9CZB3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Thumpd2Q9CZB3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Thumpd2Q9CZB3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Thumpd2Q9CZB3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Thumpd2Q9CZB3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Thumpd2Q9CZB3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Thumpd2Q9CZB3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Thumpd2Q9CZB3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Thumpd2Q9CZB3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Thumpd2Q9CZB3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Thumpd2Q9CZB3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Thumpd2Q9CZB3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Thumpd2Q9CZB3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Thumpd2Q9CZB3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Thumpd2Q9CZB3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Thumpd2Q9CZB3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Thumpd2Q9CZB3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Thumpd2Q9CZB3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Thumpd2Q9CZB3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Thumpd2Q9CZB3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Thumpd2Q9CZB3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Thumpd2Q9CZB3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Thumpd2Q9CZB3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Thumpd2Q9CZB3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Thumpd2Q9CZB3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Thumpd2Q9CZB3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Thumpd2Q9CZB3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Thumpd2Q9CZB3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Thumpd2Q9CZB3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Thumpd2Q9CZB3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Thumpd2Q9CZB3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Thumpd2Q9CZB3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Thumpd2Q9CZB3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Thumpd2Q9CZB3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Thumpd2Q9CZB3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Thumpd2Q9CZB3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Thumpd2Q9CZB3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Thumpd2Q9CZB3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Thumpd2Q9CZB3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Thumpd2Q9CZB3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Thumpd2Q9CZB3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Thumpd2Q9CZB3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Thumpd2Q9CZB3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Thumpd2Q9CZB3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Thumpd2Q9CZB3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Thumpd2Q9CZB3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Thumpd2Q9CZB3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Thumpd2Q9CZB3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Thumpd2Q9CZB3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Thumpd2Q9CZB3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Thumpd2Q9CZB3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Thumpd2Q9CZB3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Thumpd2Q9CZB3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Thumpd2Q9CZB3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms