Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ70

3110001I22Rik, MCG129801, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110001I22RikQ9CZ70 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
3110001I22RikQ9CZ70 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
3110001I22RikQ9CZ70 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
3110001I22RikQ9CZ70 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
3110001I22RikQ9CZ70 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
3110001I22RikQ9CZ70 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
3110001I22RikQ9CZ70 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
3110001I22RikQ9CZ70 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
3110001I22RikQ9CZ70 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
3110001I22RikQ9CZ70 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
3110001I22RikQ9CZ70 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
3110001I22RikQ9CZ70 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
3110001I22RikQ9CZ70 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
3110001I22RikQ9CZ70 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
3110001I22RikQ9CZ70 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
3110001I22RikQ9CZ70 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
3110001I22RikQ9CZ70 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
3110001I22RikQ9CZ70 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
3110001I22RikQ9CZ70 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
3110001I22RikQ9CZ70 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
3110001I22RikQ9CZ70 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
3110001I22RikQ9CZ70 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
3110001I22RikQ9CZ70 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
3110001I22RikQ9CZ70 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
3110001I22RikQ9CZ70 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
3110001I22RikQ9CZ70 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
3110001I22RikQ9CZ70 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
3110001I22RikQ9CZ70 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
3110001I22RikQ9CZ70 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
3110001I22RikQ9CZ70 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
3110001I22RikQ9CZ70 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
3110001I22RikQ9CZ70 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
3110001I22RikQ9CZ70 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
3110001I22RikQ9CZ70 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
3110001I22RikQ9CZ70 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
3110001I22RikQ9CZ70 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
3110001I22RikQ9CZ70 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
3110001I22RikQ9CZ70 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
3110001I22RikQ9CZ70 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
3110001I22RikQ9CZ70 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
3110001I22RikQ9CZ70 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
3110001I22RikQ9CZ70 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
3110001I22RikQ9CZ70 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
3110001I22RikQ9CZ70 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
3110001I22RikQ9CZ70 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
3110001I22RikQ9CZ70 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
3110001I22RikQ9CZ70 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
3110001I22RikQ9CZ70 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
3110001I22RikQ9CZ70 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
3110001I22RikQ9CZ70 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
3110001I22RikQ9CZ70 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
3110001I22RikQ9CZ70 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22■■□□□ 1.11
3110001I22RikQ9CZ70 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
3110001I22RikQ9CZ70 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
3110001I22RikQ9CZ70 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
3110001I22RikQ9CZ70 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
3110001I22RikQ9CZ70 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
3110001I22RikQ9CZ70 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
3110001I22RikQ9CZ70 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
3110001I22RikQ9CZ70 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
3110001I22RikQ9CZ70 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
3110001I22RikQ9CZ70 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
3110001I22RikQ9CZ70 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
3110001I22RikQ9CZ70 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
3110001I22RikQ9CZ70 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
3110001I22RikQ9CZ70 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
3110001I22RikQ9CZ70 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
3110001I22RikQ9CZ70 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
3110001I22RikQ9CZ70 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
3110001I22RikQ9CZ70 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
3110001I22RikQ9CZ70 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
3110001I22RikQ9CZ70 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
3110001I22RikQ9CZ70 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
3110001I22RikQ9CZ70 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
3110001I22RikQ9CZ70 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
3110001I22RikQ9CZ70 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
3110001I22RikQ9CZ70 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
3110001I22RikQ9CZ70 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
3110001I22RikQ9CZ70 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
3110001I22RikQ9CZ70 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
3110001I22RikQ9CZ70 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
3110001I22RikQ9CZ70 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
3110001I22RikQ9CZ70 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
3110001I22RikQ9CZ70 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
3110001I22RikQ9CZ70 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
3110001I22RikQ9CZ70 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
3110001I22RikQ9CZ70 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
3110001I22RikQ9CZ70 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
3110001I22RikQ9CZ70 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
3110001I22RikQ9CZ70 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
3110001I22RikQ9CZ70 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
3110001I22RikQ9CZ70 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
3110001I22RikQ9CZ70 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
3110001I22RikQ9CZ70 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
3110001I22RikQ9CZ70 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
3110001I22RikQ9CZ70 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
3110001I22RikQ9CZ70 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
3110001I22RikQ9CZ70 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
3110001I22RikQ9CZ70 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
3110001I22RikQ9CZ70 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms