Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYS6

Uncharacterized protein C2orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYS6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9CYS6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9CYS6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9CYS6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9CYS6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9CYS6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9CYS6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9CYS6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9CYS6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9CYS6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q9CYS6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9CYS6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9CYS6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9CYS6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9CYS6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9CYS6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9CYS6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9CYS6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9CYS6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q9CYS6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9CYS6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9CYS6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9CYS6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9CYS6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9CYS6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9CYS6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9CYS6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9CYS6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9CYS6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9CYS6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9CYS6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9CYS6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9CYS6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9CYS6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9CYS6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9CYS6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9CYS6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9CYS6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9CYS6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9CYS6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9CYS6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9CYS6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9CYS6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9CYS6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9CYS6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9CYS6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9CYS6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9CYS6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9CYS6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9CYS6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9CYS6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9CYS6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9CYS6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9CYS6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9CYS6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9CYS6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9CYS6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9CYS6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9CYS6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9CYS6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9CYS6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9CYS6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9CYS6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9CYS6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9CYS6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9CYS6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9CYS6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9CYS6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9CYS6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9CYS6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9CYS6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9CYS6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Q9CYS6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9CYS6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9CYS6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9CYS6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CYS6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CYS6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CYS6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CYS6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9CYS6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9CYS6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CYS6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CYS6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CYS6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CYS6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CYS6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9CYS6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9CYS6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CYS6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CYS6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CYS6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CYS6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CYS6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9CYS6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9CYS6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9CYS6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9CYS6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9CYS6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9CYS6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms