Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ssu72Q9CY97 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ssu72Q9CY97 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ssu72Q9CY97 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ssu72Q9CY97 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ssu72Q9CY97 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ssu72Q9CY97 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ssu72Q9CY97 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ssu72Q9CY97 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ssu72Q9CY97 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ssu72Q9CY97 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ssu72Q9CY97 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ssu72Q9CY97 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ssu72Q9CY97 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ssu72Q9CY97 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ssu72Q9CY97 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssu72Q9CY97 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssu72Q9CY97 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssu72Q9CY97 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssu72Q9CY97 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ssu72Q9CY97 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ssu72Q9CY97 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ssu72Q9CY97 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssu72Q9CY97 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssu72Q9CY97 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ssu72Q9CY97 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssu72Q9CY97 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssu72Q9CY97 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssu72Q9CY97 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssu72Q9CY97 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssu72Q9CY97 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssu72Q9CY97 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssu72Q9CY97 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssu72Q9CY97 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ssu72Q9CY97 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ssu72Q9CY97 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ssu72Q9CY97 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ssu72Q9CY97 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ssu72Q9CY97 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ssu72Q9CY97 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ssu72Q9CY97 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ssu72Q9CY97 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ssu72Q9CY97 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ssu72Q9CY97 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ssu72Q9CY97 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ssu72Q9CY97 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ssu72Q9CY97 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ssu72Q9CY97 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ssu72Q9CY97 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ssu72Q9CY97 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ssu72Q9CY97 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ssu72Q9CY97 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ssu72Q9CY97 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ssu72Q9CY97 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ssu72Q9CY97 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ssu72Q9CY97 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ssu72Q9CY97 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ssu72Q9CY97 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ssu72Q9CY97 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ssu72Q9CY97 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ssu72Q9CY97 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssu72Q9CY97 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssu72Q9CY97 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssu72Q9CY97 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ssu72Q9CY97 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ssu72Q9CY97 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ssu72Q9CY97 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ssu72Q9CY97 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ssu72Q9CY97 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ssu72Q9CY97 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ssu72Q9CY97 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ssu72Q9CY97 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ssu72Q9CY97 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ssu72Q9CY97 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ssu72Q9CY97 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ssu72Q9CY97 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ssu72Q9CY97 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ssu72Q9CY97 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ssu72Q9CY97 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ssu72Q9CY97 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ssu72Q9CY97 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ssu72Q9CY97 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ssu72Q9CY97 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ssu72Q9CY97 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ssu72Q9CY97 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ssu72Q9CY97 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ssu72Q9CY97 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ssu72Q9CY97 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ssu72Q9CY97 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ssu72Q9CY97 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ssu72Q9CY97 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ssu72Q9CY97 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ssu72Q9CY97 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ssu72Q9CY97 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ssu72Q9CY97 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ssu72Q9CY97 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ssu72Q9CY97 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ssu72Q9CY97 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ssu72Q9CY97 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ssu72Q9CY97 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms