Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snx7Q9CY18 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snx7Q9CY18 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snx7Q9CY18 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snx7Q9CY18 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snx7Q9CY18 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snx7Q9CY18 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snx7Q9CY18 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snx7Q9CY18 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snx7Q9CY18 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snx7Q9CY18 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snx7Q9CY18 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snx7Q9CY18 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snx7Q9CY18 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snx7Q9CY18 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx7Q9CY18 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx7Q9CY18 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx7Q9CY18 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx7Q9CY18 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx7Q9CY18 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx7Q9CY18 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Snx7Q9CY18 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx7Q9CY18 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx7Q9CY18 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx7Q9CY18 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snx7Q9CY18 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snx7Q9CY18 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snx7Q9CY18 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snx7Q9CY18 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snx7Q9CY18 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snx7Q9CY18 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snx7Q9CY18 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx7Q9CY18 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snx7Q9CY18 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx7Q9CY18 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx7Q9CY18 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx7Q9CY18 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx7Q9CY18 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx7Q9CY18 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx7Q9CY18 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx7Q9CY18 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx7Q9CY18 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snx7Q9CY18 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx7Q9CY18 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx7Q9CY18 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx7Q9CY18 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx7Q9CY18 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx7Q9CY18 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx7Q9CY18 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx7Q9CY18 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx7Q9CY18 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Snx7Q9CY18 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snx7Q9CY18 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx7Q9CY18 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx7Q9CY18 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snx7Q9CY18 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snx7Q9CY18 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snx7Q9CY18 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx7Q9CY18 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx7Q9CY18 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx7Q9CY18 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx7Q9CY18 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx7Q9CY18 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx7Q9CY18 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx7Q9CY18 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx7Q9CY18 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx7Q9CY18 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx7Q9CY18 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx7Q9CY18 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx7Q9CY18 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx7Q9CY18 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx7Q9CY18 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx7Q9CY18 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx7Q9CY18 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx7Q9CY18 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx7Q9CY18 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx7Q9CY18 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx7Q9CY18 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx7Q9CY18 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx7Q9CY18 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx7Q9CY18 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx7Q9CY18 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx7Q9CY18 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx7Q9CY18 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx7Q9CY18 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx7Q9CY18 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx7Q9CY18 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx7Q9CY18 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx7Q9CY18 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx7Q9CY18 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx7Q9CY18 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx7Q9CY18 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx7Q9CY18 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx7Q9CY18 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx7Q9CY18 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx7Q9CY18 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx7Q9CY18 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx7Q9CY18 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx7Q9CY18 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx7Q9CY18 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms