Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sgo1Q9CXH7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sgo1Q9CXH7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sgo1Q9CXH7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sgo1Q9CXH7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sgo1Q9CXH7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sgo1Q9CXH7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sgo1Q9CXH7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sgo1Q9CXH7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sgo1Q9CXH7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sgo1Q9CXH7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sgo1Q9CXH7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sgo1Q9CXH7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sgo1Q9CXH7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sgo1Q9CXH7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sgo1Q9CXH7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sgo1Q9CXH7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sgo1Q9CXH7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sgo1Q9CXH7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sgo1Q9CXH7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sgo1Q9CXH7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sgo1Q9CXH7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sgo1Q9CXH7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sgo1Q9CXH7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sgo1Q9CXH7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sgo1Q9CXH7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sgo1Q9CXH7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sgo1Q9CXH7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sgo1Q9CXH7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sgo1Q9CXH7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sgo1Q9CXH7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sgo1Q9CXH7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sgo1Q9CXH7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sgo1Q9CXH7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sgo1Q9CXH7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sgo1Q9CXH7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sgo1Q9CXH7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sgo1Q9CXH7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sgo1Q9CXH7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sgo1Q9CXH7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sgo1Q9CXH7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sgo1Q9CXH7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sgo1Q9CXH7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sgo1Q9CXH7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sgo1Q9CXH7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sgo1Q9CXH7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sgo1Q9CXH7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sgo1Q9CXH7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sgo1Q9CXH7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sgo1Q9CXH7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sgo1Q9CXH7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sgo1Q9CXH7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sgo1Q9CXH7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sgo1Q9CXH7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sgo1Q9CXH7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sgo1Q9CXH7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sgo1Q9CXH7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sgo1Q9CXH7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sgo1Q9CXH7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sgo1Q9CXH7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sgo1Q9CXH7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sgo1Q9CXH7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sgo1Q9CXH7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sgo1Q9CXH7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sgo1Q9CXH7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sgo1Q9CXH7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sgo1Q9CXH7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sgo1Q9CXH7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sgo1Q9CXH7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sgo1Q9CXH7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sgo1Q9CXH7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sgo1Q9CXH7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sgo1Q9CXH7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sgo1Q9CXH7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sgo1Q9CXH7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sgo1Q9CXH7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sgo1Q9CXH7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sgo1Q9CXH7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sgo1Q9CXH7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sgo1Q9CXH7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sgo1Q9CXH7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sgo1Q9CXH7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sgo1Q9CXH7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sgo1Q9CXH7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sgo1Q9CXH7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sgo1Q9CXH7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sgo1Q9CXH7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sgo1Q9CXH7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sgo1Q9CXH7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sgo1Q9CXH7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sgo1Q9CXH7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sgo1Q9CXH7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sgo1Q9CXH7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sgo1Q9CXH7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sgo1Q9CXH7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sgo1Q9CXH7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sgo1Q9CXH7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.8 ms