Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH6

Psma8, Proteasome subunit alpha type-7-like, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma8Q9CWH6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Psma8Q9CWH6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Psma8Q9CWH6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psma8Q9CWH6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psma8Q9CWH6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psma8Q9CWH6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psma8Q9CWH6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psma8Q9CWH6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psma8Q9CWH6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Psma8Q9CWH6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Psma8Q9CWH6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psma8Q9CWH6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psma8Q9CWH6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psma8Q9CWH6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psma8Q9CWH6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psma8Q9CWH6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psma8Q9CWH6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psma8Q9CWH6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Psma8Q9CWH6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Psma8Q9CWH6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Psma8Q9CWH6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Psma8Q9CWH6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Psma8Q9CWH6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psma8Q9CWH6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psma8Q9CWH6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psma8Q9CWH6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psma8Q9CWH6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psma8Q9CWH6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psma8Q9CWH6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psma8Q9CWH6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psma8Q9CWH6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psma8Q9CWH6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psma8Q9CWH6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psma8Q9CWH6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psma8Q9CWH6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psma8Q9CWH6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Psma8Q9CWH6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Psma8Q9CWH6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Psma8Q9CWH6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Psma8Q9CWH6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Psma8Q9CWH6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Psma8Q9CWH6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Psma8Q9CWH6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Psma8Q9CWH6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Psma8Q9CWH6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Psma8Q9CWH6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Psma8Q9CWH6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Psma8Q9CWH6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psma8Q9CWH6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psma8Q9CWH6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psma8Q9CWH6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psma8Q9CWH6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psma8Q9CWH6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psma8Q9CWH6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psma8Q9CWH6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Psma8Q9CWH6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Psma8Q9CWH6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Psma8Q9CWH6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Psma8Q9CWH6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Psma8Q9CWH6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psma8Q9CWH6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Psma8Q9CWH6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psma8Q9CWH6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psma8Q9CWH6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psma8Q9CWH6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psma8Q9CWH6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psma8Q9CWH6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psma8Q9CWH6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psma8Q9CWH6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psma8Q9CWH6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psma8Q9CWH6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psma8Q9CWH6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psma8Q9CWH6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psma8Q9CWH6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psma8Q9CWH6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psma8Q9CWH6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psma8Q9CWH6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psma8Q9CWH6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psma8Q9CWH6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psma8Q9CWH6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psma8Q9CWH6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psma8Q9CWH6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psma8Q9CWH6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psma8Q9CWH6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psma8Q9CWH6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psma8Q9CWH6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Psma8Q9CWH6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Psma8Q9CWH6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psma8Q9CWH6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psma8Q9CWH6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psma8Q9CWH6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psma8Q9CWH6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psma8Q9CWH6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psma8Q9CWH6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psma8Q9CWH6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psma8Q9CWH6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psma8Q9CWH6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psma8Q9CWH6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psma8Q9CWH6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Psma8Q9CWH6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms