Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Atxn3Q9CVD2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Atxn3Q9CVD2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Atxn3Q9CVD2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Atxn3Q9CVD2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Atxn3Q9CVD2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Atxn3Q9CVD2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Atxn3Q9CVD2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Atxn3Q9CVD2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Atxn3Q9CVD2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Atxn3Q9CVD2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Atxn3Q9CVD2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Atxn3Q9CVD2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Atxn3Q9CVD2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Atxn3Q9CVD2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Atxn3Q9CVD2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Atxn3Q9CVD2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Atxn3Q9CVD2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Atxn3Q9CVD2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Atxn3Q9CVD2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Atxn3Q9CVD2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Atxn3Q9CVD2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Atxn3Q9CVD2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Atxn3Q9CVD2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Atxn3Q9CVD2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Atxn3Q9CVD2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Atxn3Q9CVD2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Atxn3Q9CVD2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Atxn3Q9CVD2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
Atxn3Q9CVD2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Atxn3Q9CVD2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Atxn3Q9CVD2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Atxn3Q9CVD2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Atxn3Q9CVD2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Atxn3Q9CVD2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Atxn3Q9CVD2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Atxn3Q9CVD2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Atxn3Q9CVD2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Atxn3Q9CVD2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Atxn3Q9CVD2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Atxn3Q9CVD2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Atxn3Q9CVD2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Atxn3Q9CVD2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Atxn3Q9CVD2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Atxn3Q9CVD2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Atxn3Q9CVD2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Atxn3Q9CVD2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Atxn3Q9CVD2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Atxn3Q9CVD2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Atxn3Q9CVD2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Atxn3Q9CVD2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Atxn3Q9CVD2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Atxn3Q9CVD2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Atxn3Q9CVD2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Atxn3Q9CVD2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Atxn3Q9CVD2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Atxn3Q9CVD2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Atxn3Q9CVD2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Atxn3Q9CVD2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Atxn3Q9CVD2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Atxn3Q9CVD2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Atxn3Q9CVD2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Atxn3Q9CVD2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Atxn3Q9CVD2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Atxn3Q9CVD2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Atxn3Q9CVD2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Atxn3Q9CVD2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Atxn3Q9CVD2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Atxn3Q9CVD2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Atxn3Q9CVD2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Atxn3Q9CVD2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Atxn3Q9CVD2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Atxn3Q9CVD2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Atxn3Q9CVD2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Atxn3Q9CVD2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Atxn3Q9CVD2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Atxn3Q9CVD2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Atxn3Q9CVD2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Atxn3Q9CVD2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Atxn3Q9CVD2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Atxn3Q9CVD2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Atxn3Q9CVD2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Atxn3Q9CVD2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Atxn3Q9CVD2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Atxn3Q9CVD2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Atxn3Q9CVD2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Atxn3Q9CVD2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Atxn3Q9CVD2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Atxn3Q9CVD2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Atxn3Q9CVD2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Atxn3Q9CVD2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Atxn3Q9CVD2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Atxn3Q9CVD2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Atxn3Q9CVD2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Atxn3Q9CVD2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Atxn3Q9CVD2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Atxn3Q9CVD2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Atxn3Q9CVD2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Atxn3Q9CVD2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Atxn3Q9CVD2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms