Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV82

2310003L06Rik, RIKEN cDNA 2310003L06 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310003L06RikQ9CV82 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
2310003L06RikQ9CV82 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
2310003L06RikQ9CV82 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
2310003L06RikQ9CV82 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
2310003L06RikQ9CV82 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
2310003L06RikQ9CV82 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
2310003L06RikQ9CV82 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
2310003L06RikQ9CV82 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
2310003L06RikQ9CV82 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
2310003L06RikQ9CV82 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
2310003L06RikQ9CV82 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
2310003L06RikQ9CV82 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
2310003L06RikQ9CV82 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
2310003L06RikQ9CV82 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
2310003L06RikQ9CV82 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
2310003L06RikQ9CV82 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
2310003L06RikQ9CV82 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
2310003L06RikQ9CV82 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
2310003L06RikQ9CV82 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
2310003L06RikQ9CV82 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
2310003L06RikQ9CV82 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
2310003L06RikQ9CV82 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
2310003L06RikQ9CV82 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
2310003L06RikQ9CV82 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
2310003L06RikQ9CV82 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
2310003L06RikQ9CV82 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
2310003L06RikQ9CV82 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
2310003L06RikQ9CV82 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
2310003L06RikQ9CV82 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
2310003L06RikQ9CV82 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
2310003L06RikQ9CV82 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
2310003L06RikQ9CV82 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
2310003L06RikQ9CV82 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
2310003L06RikQ9CV82 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
2310003L06RikQ9CV82 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
2310003L06RikQ9CV82 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
2310003L06RikQ9CV82 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
2310003L06RikQ9CV82 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
2310003L06RikQ9CV82 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
2310003L06RikQ9CV82 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
2310003L06RikQ9CV82 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
2310003L06RikQ9CV82 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
2310003L06RikQ9CV82 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
2310003L06RikQ9CV82 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
2310003L06RikQ9CV82 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
2310003L06RikQ9CV82 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
2310003L06RikQ9CV82 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
2310003L06RikQ9CV82 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
2310003L06RikQ9CV82 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
2310003L06RikQ9CV82 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
2310003L06RikQ9CV82 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
2310003L06RikQ9CV82 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
2310003L06RikQ9CV82 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
2310003L06RikQ9CV82 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
2310003L06RikQ9CV82 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
2310003L06RikQ9CV82 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
2310003L06RikQ9CV82 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
2310003L06RikQ9CV82 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
2310003L06RikQ9CV82 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
2310003L06RikQ9CV82 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
2310003L06RikQ9CV82 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
2310003L06RikQ9CV82 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
2310003L06RikQ9CV82 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
2310003L06RikQ9CV82 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
2310003L06RikQ9CV82 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
2310003L06RikQ9CV82 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
2310003L06RikQ9CV82 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
2310003L06RikQ9CV82 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
2310003L06RikQ9CV82 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
2310003L06RikQ9CV82 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
2310003L06RikQ9CV82 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
2310003L06RikQ9CV82 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
2310003L06RikQ9CV82 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
2310003L06RikQ9CV82 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
2310003L06RikQ9CV82 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
2310003L06RikQ9CV82 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
2310003L06RikQ9CV82 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
2310003L06RikQ9CV82 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
2310003L06RikQ9CV82 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
2310003L06RikQ9CV82 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
2310003L06RikQ9CV82 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
2310003L06RikQ9CV82 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
2310003L06RikQ9CV82 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
2310003L06RikQ9CV82 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
2310003L06RikQ9CV82 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
2310003L06RikQ9CV82 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
2310003L06RikQ9CV82 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
2310003L06RikQ9CV82 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
2310003L06RikQ9CV82 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
2310003L06RikQ9CV82 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
2310003L06RikQ9CV82 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
2310003L06RikQ9CV82 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
2310003L06RikQ9CV82 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
2310003L06RikQ9CV82 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
2310003L06RikQ9CV82 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
2310003L06RikQ9CV82 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
2310003L06RikQ9CV82 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
2310003L06RikQ9CV82 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
2310003L06RikQ9CV82 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
2310003L06RikQ9CV82 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms