Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930535I16RikQ9CUI2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930535I16RikQ9CUI2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930535I16RikQ9CUI2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930535I16RikQ9CUI2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930535I16RikQ9CUI2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930535I16RikQ9CUI2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930535I16RikQ9CUI2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930535I16RikQ9CUI2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930535I16RikQ9CUI2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930535I16RikQ9CUI2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930535I16RikQ9CUI2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930535I16RikQ9CUI2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930535I16RikQ9CUI2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930535I16RikQ9CUI2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930535I16RikQ9CUI2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930535I16RikQ9CUI2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930535I16RikQ9CUI2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930535I16RikQ9CUI2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930535I16RikQ9CUI2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930535I16RikQ9CUI2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930535I16RikQ9CUI2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930535I16RikQ9CUI2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930535I16RikQ9CUI2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930535I16RikQ9CUI2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930535I16RikQ9CUI2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930535I16RikQ9CUI2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930535I16RikQ9CUI2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930535I16RikQ9CUI2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930535I16RikQ9CUI2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930535I16RikQ9CUI2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930535I16RikQ9CUI2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930535I16RikQ9CUI2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930535I16RikQ9CUI2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930535I16RikQ9CUI2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930535I16RikQ9CUI2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930535I16RikQ9CUI2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930535I16RikQ9CUI2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930535I16RikQ9CUI2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930535I16RikQ9CUI2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930535I16RikQ9CUI2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930535I16RikQ9CUI2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930535I16RikQ9CUI2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930535I16RikQ9CUI2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930535I16RikQ9CUI2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930535I16RikQ9CUI2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930535I16RikQ9CUI2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930535I16RikQ9CUI2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930535I16RikQ9CUI2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930535I16RikQ9CUI2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930535I16RikQ9CUI2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930535I16RikQ9CUI2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930535I16RikQ9CUI2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
4930535I16RikQ9CUI2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930535I16RikQ9CUI2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930535I16RikQ9CUI2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930535I16RikQ9CUI2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930535I16RikQ9CUI2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930535I16RikQ9CUI2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930535I16RikQ9CUI2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930535I16RikQ9CUI2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930535I16RikQ9CUI2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930535I16RikQ9CUI2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930535I16RikQ9CUI2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930535I16RikQ9CUI2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930535I16RikQ9CUI2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930535I16RikQ9CUI2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930535I16RikQ9CUI2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930535I16RikQ9CUI2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930535I16RikQ9CUI2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930535I16RikQ9CUI2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930535I16RikQ9CUI2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930535I16RikQ9CUI2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930535I16RikQ9CUI2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930535I16RikQ9CUI2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930535I16RikQ9CUI2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930535I16RikQ9CUI2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930535I16RikQ9CUI2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930535I16RikQ9CUI2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930535I16RikQ9CUI2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930535I16RikQ9CUI2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930535I16RikQ9CUI2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4930535I16RikQ9CUI2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930535I16RikQ9CUI2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930535I16RikQ9CUI2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930535I16RikQ9CUI2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930535I16RikQ9CUI2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930535I16RikQ9CUI2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930535I16RikQ9CUI2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930535I16RikQ9CUI2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930535I16RikQ9CUI2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930535I16RikQ9CUI2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.7 ms