Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB2

Nhp2, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhp2Q9CRB2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nhp2Q9CRB2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nhp2Q9CRB2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nhp2Q9CRB2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nhp2Q9CRB2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nhp2Q9CRB2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nhp2Q9CRB2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nhp2Q9CRB2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nhp2Q9CRB2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nhp2Q9CRB2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nhp2Q9CRB2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Nhp2Q9CRB2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nhp2Q9CRB2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nhp2Q9CRB2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nhp2Q9CRB2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nhp2Q9CRB2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nhp2Q9CRB2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nhp2Q9CRB2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nhp2Q9CRB2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nhp2Q9CRB2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nhp2Q9CRB2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nhp2Q9CRB2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nhp2Q9CRB2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nhp2Q9CRB2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nhp2Q9CRB2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nhp2Q9CRB2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nhp2Q9CRB2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nhp2Q9CRB2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nhp2Q9CRB2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nhp2Q9CRB2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nhp2Q9CRB2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nhp2Q9CRB2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nhp2Q9CRB2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nhp2Q9CRB2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nhp2Q9CRB2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nhp2Q9CRB2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nhp2Q9CRB2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nhp2Q9CRB2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nhp2Q9CRB2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nhp2Q9CRB2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nhp2Q9CRB2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nhp2Q9CRB2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nhp2Q9CRB2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nhp2Q9CRB2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nhp2Q9CRB2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nhp2Q9CRB2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nhp2Q9CRB2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nhp2Q9CRB2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nhp2Q9CRB2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nhp2Q9CRB2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nhp2Q9CRB2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nhp2Q9CRB2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nhp2Q9CRB2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nhp2Q9CRB2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nhp2Q9CRB2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nhp2Q9CRB2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nhp2Q9CRB2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nhp2Q9CRB2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nhp2Q9CRB2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nhp2Q9CRB2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nhp2Q9CRB2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nhp2Q9CRB2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nhp2Q9CRB2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nhp2Q9CRB2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nhp2Q9CRB2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nhp2Q9CRB2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nhp2Q9CRB2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nhp2Q9CRB2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nhp2Q9CRB2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nhp2Q9CRB2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nhp2Q9CRB2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nhp2Q9CRB2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nhp2Q9CRB2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nhp2Q9CRB2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhp2Q9CRB2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhp2Q9CRB2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nhp2Q9CRB2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nhp2Q9CRB2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nhp2Q9CRB2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nhp2Q9CRB2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nhp2Q9CRB2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nhp2Q9CRB2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nhp2Q9CRB2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nhp2Q9CRB2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nhp2Q9CRB2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhp2Q9CRB2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhp2Q9CRB2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhp2Q9CRB2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhp2Q9CRB2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhp2Q9CRB2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Nhp2Q9CRB2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nhp2Q9CRB2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nhp2Q9CRB2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nhp2Q9CRB2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nhp2Q9CRB2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nhp2Q9CRB2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nhp2Q9CRB2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nhp2Q9CRB2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhp2Q9CRB2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nhp2Q9CRB2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms