Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Exosc5Q9CRA8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Exosc5Q9CRA8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Exosc5Q9CRA8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Exosc5Q9CRA8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Exosc5Q9CRA8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Exosc5Q9CRA8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Exosc5Q9CRA8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Exosc5Q9CRA8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Exosc5Q9CRA8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Exosc5Q9CRA8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Exosc5Q9CRA8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Exosc5Q9CRA8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Exosc5Q9CRA8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Exosc5Q9CRA8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Exosc5Q9CRA8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Exosc5Q9CRA8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Exosc5Q9CRA8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Exosc5Q9CRA8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Exosc5Q9CRA8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Exosc5Q9CRA8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Exosc5Q9CRA8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Exosc5Q9CRA8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Exosc5Q9CRA8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Exosc5Q9CRA8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Exosc5Q9CRA8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Exosc5Q9CRA8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Exosc5Q9CRA8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Exosc5Q9CRA8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Exosc5Q9CRA8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Exosc5Q9CRA8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Exosc5Q9CRA8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Exosc5Q9CRA8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Exosc5Q9CRA8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Exosc5Q9CRA8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Exosc5Q9CRA8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Exosc5Q9CRA8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Exosc5Q9CRA8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Exosc5Q9CRA8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Exosc5Q9CRA8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Exosc5Q9CRA8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Exosc5Q9CRA8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Exosc5Q9CRA8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Exosc5Q9CRA8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Exosc5Q9CRA8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Exosc5Q9CRA8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Exosc5Q9CRA8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Exosc5Q9CRA8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Exosc5Q9CRA8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Exosc5Q9CRA8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Exosc5Q9CRA8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Exosc5Q9CRA8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Exosc5Q9CRA8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Exosc5Q9CRA8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Exosc5Q9CRA8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Exosc5Q9CRA8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Exosc5Q9CRA8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exosc5Q9CRA8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exosc5Q9CRA8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Exosc5Q9CRA8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Exosc5Q9CRA8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Exosc5Q9CRA8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Exosc5Q9CRA8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Exosc5Q9CRA8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Exosc5Q9CRA8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Exosc5Q9CRA8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exosc5Q9CRA8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Exosc5Q9CRA8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exosc5Q9CRA8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Exosc5Q9CRA8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exosc5Q9CRA8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exosc5Q9CRA8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exosc5Q9CRA8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exosc5Q9CRA8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Exosc5Q9CRA8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Exosc5Q9CRA8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exosc5Q9CRA8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exosc5Q9CRA8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exosc5Q9CRA8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exosc5Q9CRA8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Exosc5Q9CRA8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Exosc5Q9CRA8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Exosc5Q9CRA8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exosc5Q9CRA8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exosc5Q9CRA8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exosc5Q9CRA8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Exosc5Q9CRA8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Exosc5Q9CRA8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Exosc5Q9CRA8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Exosc5Q9CRA8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Exosc5Q9CRA8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Exosc5Q9CRA8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Exosc5Q9CRA8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Exosc5Q9CRA8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Exosc5Q9CRA8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Exosc5Q9CRA8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Exosc5Q9CRA8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Exosc5Q9CRA8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Exosc5Q9CRA8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Exosc5Q9CRA8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms