Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Msmo1Q9CRA4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Msmo1Q9CRA4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Msmo1Q9CRA4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Msmo1Q9CRA4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Msmo1Q9CRA4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Msmo1Q9CRA4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Msmo1Q9CRA4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Msmo1Q9CRA4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Msmo1Q9CRA4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Msmo1Q9CRA4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Msmo1Q9CRA4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Msmo1Q9CRA4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Msmo1Q9CRA4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Msmo1Q9CRA4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Msmo1Q9CRA4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Msmo1Q9CRA4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Msmo1Q9CRA4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Msmo1Q9CRA4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Msmo1Q9CRA4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msmo1Q9CRA4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msmo1Q9CRA4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msmo1Q9CRA4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Msmo1Q9CRA4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Msmo1Q9CRA4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Msmo1Q9CRA4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Msmo1Q9CRA4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Msmo1Q9CRA4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Msmo1Q9CRA4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msmo1Q9CRA4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msmo1Q9CRA4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msmo1Q9CRA4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msmo1Q9CRA4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msmo1Q9CRA4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Msmo1Q9CRA4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Msmo1Q9CRA4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Msmo1Q9CRA4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Msmo1Q9CRA4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Msmo1Q9CRA4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Msmo1Q9CRA4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Msmo1Q9CRA4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Msmo1Q9CRA4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Msmo1Q9CRA4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Msmo1Q9CRA4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Msmo1Q9CRA4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Msmo1Q9CRA4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Msmo1Q9CRA4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Msmo1Q9CRA4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Msmo1Q9CRA4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Msmo1Q9CRA4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Msmo1Q9CRA4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Msmo1Q9CRA4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Msmo1Q9CRA4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Msmo1Q9CRA4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Msmo1Q9CRA4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Msmo1Q9CRA4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Msmo1Q9CRA4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Msmo1Q9CRA4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Msmo1Q9CRA4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Msmo1Q9CRA4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Msmo1Q9CRA4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Msmo1Q9CRA4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Msmo1Q9CRA4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Msmo1Q9CRA4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Msmo1Q9CRA4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Msmo1Q9CRA4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Msmo1Q9CRA4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Msmo1Q9CRA4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Msmo1Q9CRA4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Msmo1Q9CRA4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Msmo1Q9CRA4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Msmo1Q9CRA4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Msmo1Q9CRA4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Msmo1Q9CRA4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Msmo1Q9CRA4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Msmo1Q9CRA4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msmo1Q9CRA4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msmo1Q9CRA4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msmo1Q9CRA4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msmo1Q9CRA4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msmo1Q9CRA4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Msmo1Q9CRA4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Msmo1Q9CRA4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Msmo1Q9CRA4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Msmo1Q9CRA4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Msmo1Q9CRA4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msmo1Q9CRA4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msmo1Q9CRA4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msmo1Q9CRA4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msmo1Q9CRA4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msmo1Q9CRA4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msmo1Q9CRA4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Msmo1Q9CRA4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Msmo1Q9CRA4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Msmo1Q9CRA4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Msmo1Q9CRA4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Msmo1Q9CRA4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Msmo1Q9CRA4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Msmo1Q9CRA4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Msmo1Q9CRA4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms