Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR41

Hypk, Huntingtin-interacting protein K, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HypkQ9CR41 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
HypkQ9CR41 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
HypkQ9CR41 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
HypkQ9CR41 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
HypkQ9CR41 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
HypkQ9CR41 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
HypkQ9CR41 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
HypkQ9CR41 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
HypkQ9CR41 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
HypkQ9CR41 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
HypkQ9CR41 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
HypkQ9CR41 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HypkQ9CR41 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
HypkQ9CR41 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HypkQ9CR41 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
HypkQ9CR41 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
HypkQ9CR41 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
HypkQ9CR41 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
HypkQ9CR41 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
HypkQ9CR41 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
HypkQ9CR41 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HypkQ9CR41 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HypkQ9CR41 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HypkQ9CR41 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HypkQ9CR41 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
HypkQ9CR41 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
HypkQ9CR41 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
HypkQ9CR41 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
HypkQ9CR41 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
HypkQ9CR41 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
HypkQ9CR41 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
HypkQ9CR41 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
HypkQ9CR41 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HypkQ9CR41 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
HypkQ9CR41 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
HypkQ9CR41 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HypkQ9CR41 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
HypkQ9CR41 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HypkQ9CR41 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HypkQ9CR41 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
HypkQ9CR41 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
HypkQ9CR41 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
HypkQ9CR41 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
HypkQ9CR41 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
HypkQ9CR41 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
HypkQ9CR41 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
HypkQ9CR41 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
HypkQ9CR41 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
HypkQ9CR41 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
HypkQ9CR41 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
HypkQ9CR41 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
HypkQ9CR41 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
HypkQ9CR41 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
HypkQ9CR41 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
HypkQ9CR41 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
HypkQ9CR41 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
HypkQ9CR41 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
HypkQ9CR41 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HypkQ9CR41 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
HypkQ9CR41 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
HypkQ9CR41 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
HypkQ9CR41 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
HypkQ9CR41 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
HypkQ9CR41 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
HypkQ9CR41 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
HypkQ9CR41 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
HypkQ9CR41 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
HypkQ9CR41 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
HypkQ9CR41 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
HypkQ9CR41 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
HypkQ9CR41 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
HypkQ9CR41 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
HypkQ9CR41 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
HypkQ9CR41 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
HypkQ9CR41 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
HypkQ9CR41 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
HypkQ9CR41 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
HypkQ9CR41 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
HypkQ9CR41 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
HypkQ9CR41 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
HypkQ9CR41 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
HypkQ9CR41 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
HypkQ9CR41 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
HypkQ9CR41 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
HypkQ9CR41 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HypkQ9CR41 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HypkQ9CR41 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HypkQ9CR41 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
HypkQ9CR41 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
HypkQ9CR41 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
HypkQ9CR41 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
HypkQ9CR41 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
HypkQ9CR41 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
HypkQ9CR41 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
HypkQ9CR41 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
HypkQ9CR41 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
HypkQ9CR41 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
HypkQ9CR41 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
HypkQ9CR41 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
HypkQ9CR41 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms