Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX6

Gm16286, MCG141091, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16286Q9CQX6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm16286Q9CQX6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm16286Q9CQX6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm16286Q9CQX6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm16286Q9CQX6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm16286Q9CQX6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm16286Q9CQX6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm16286Q9CQX6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm16286Q9CQX6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm16286Q9CQX6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm16286Q9CQX6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm16286Q9CQX6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm16286Q9CQX6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm16286Q9CQX6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm16286Q9CQX6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm16286Q9CQX6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm16286Q9CQX6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm16286Q9CQX6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm16286Q9CQX6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm16286Q9CQX6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm16286Q9CQX6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm16286Q9CQX6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm16286Q9CQX6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm16286Q9CQX6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm16286Q9CQX6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm16286Q9CQX6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm16286Q9CQX6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm16286Q9CQX6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm16286Q9CQX6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm16286Q9CQX6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm16286Q9CQX6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm16286Q9CQX6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm16286Q9CQX6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm16286Q9CQX6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm16286Q9CQX6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm16286Q9CQX6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm16286Q9CQX6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm16286Q9CQX6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm16286Q9CQX6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm16286Q9CQX6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm16286Q9CQX6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm16286Q9CQX6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm16286Q9CQX6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm16286Q9CQX6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm16286Q9CQX6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm16286Q9CQX6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm16286Q9CQX6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm16286Q9CQX6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm16286Q9CQX6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm16286Q9CQX6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm16286Q9CQX6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm16286Q9CQX6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm16286Q9CQX6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm16286Q9CQX6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm16286Q9CQX6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm16286Q9CQX6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm16286Q9CQX6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm16286Q9CQX6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm16286Q9CQX6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm16286Q9CQX6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm16286Q9CQX6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm16286Q9CQX6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm16286Q9CQX6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm16286Q9CQX6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm16286Q9CQX6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm16286Q9CQX6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm16286Q9CQX6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm16286Q9CQX6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm16286Q9CQX6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm16286Q9CQX6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm16286Q9CQX6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm16286Q9CQX6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm16286Q9CQX6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm16286Q9CQX6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm16286Q9CQX6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm16286Q9CQX6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm16286Q9CQX6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm16286Q9CQX6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm16286Q9CQX6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm16286Q9CQX6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm16286Q9CQX6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm16286Q9CQX6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm16286Q9CQX6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm16286Q9CQX6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm16286Q9CQX6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm16286Q9CQX6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm16286Q9CQX6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm16286Q9CQX6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm16286Q9CQX6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm16286Q9CQX6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm16286Q9CQX6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gm16286Q9CQX6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm16286Q9CQX6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm16286Q9CQX6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm16286Q9CQX6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm16286Q9CQX6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm16286Q9CQX6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm16286Q9CQX6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gm16286Q9CQX6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm16286Q9CQX6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms