Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PompQ9CQT5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PompQ9CQT5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PompQ9CQT5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PompQ9CQT5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PompQ9CQT5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PompQ9CQT5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PompQ9CQT5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PompQ9CQT5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PompQ9CQT5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PompQ9CQT5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PompQ9CQT5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PompQ9CQT5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PompQ9CQT5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PompQ9CQT5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PompQ9CQT5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PompQ9CQT5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PompQ9CQT5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PompQ9CQT5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PompQ9CQT5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PompQ9CQT5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PompQ9CQT5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PompQ9CQT5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PompQ9CQT5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PompQ9CQT5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PompQ9CQT5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PompQ9CQT5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PompQ9CQT5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PompQ9CQT5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PompQ9CQT5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PompQ9CQT5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PompQ9CQT5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PompQ9CQT5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PompQ9CQT5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PompQ9CQT5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PompQ9CQT5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PompQ9CQT5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PompQ9CQT5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PompQ9CQT5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PompQ9CQT5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PompQ9CQT5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PompQ9CQT5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PompQ9CQT5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PompQ9CQT5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PompQ9CQT5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PompQ9CQT5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PompQ9CQT5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PompQ9CQT5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PompQ9CQT5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PompQ9CQT5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PompQ9CQT5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PompQ9CQT5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PompQ9CQT5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PompQ9CQT5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PompQ9CQT5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PompQ9CQT5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PompQ9CQT5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PompQ9CQT5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PompQ9CQT5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PompQ9CQT5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PompQ9CQT5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PompQ9CQT5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PompQ9CQT5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PompQ9CQT5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PompQ9CQT5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PompQ9CQT5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PompQ9CQT5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PompQ9CQT5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PompQ9CQT5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PompQ9CQT5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PompQ9CQT5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PompQ9CQT5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PompQ9CQT5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PompQ9CQT5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PompQ9CQT5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PompQ9CQT5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PompQ9CQT5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PompQ9CQT5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PompQ9CQT5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PompQ9CQT5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PompQ9CQT5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PompQ9CQT5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PompQ9CQT5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PompQ9CQT5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PompQ9CQT5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PompQ9CQT5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PompQ9CQT5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PompQ9CQT5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PompQ9CQT5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PompQ9CQT5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PompQ9CQT5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PompQ9CQT5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PompQ9CQT5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PompQ9CQT5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PompQ9CQT5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PompQ9CQT5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PompQ9CQT5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PompQ9CQT5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PompQ9CQT5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PompQ9CQT5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms