Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT1

Mri1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mri1Q9CQT1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Mri1Q9CQT1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mri1Q9CQT1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mri1Q9CQT1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mri1Q9CQT1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mri1Q9CQT1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mri1Q9CQT1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mri1Q9CQT1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mri1Q9CQT1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mri1Q9CQT1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mri1Q9CQT1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mri1Q9CQT1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mri1Q9CQT1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mri1Q9CQT1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mri1Q9CQT1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mri1Q9CQT1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mri1Q9CQT1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mri1Q9CQT1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mri1Q9CQT1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mri1Q9CQT1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mri1Q9CQT1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mri1Q9CQT1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mri1Q9CQT1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mri1Q9CQT1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mri1Q9CQT1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mri1Q9CQT1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mri1Q9CQT1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mri1Q9CQT1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mri1Q9CQT1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mri1Q9CQT1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mri1Q9CQT1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mri1Q9CQT1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mri1Q9CQT1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mri1Q9CQT1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mri1Q9CQT1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mri1Q9CQT1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mri1Q9CQT1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mri1Q9CQT1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mri1Q9CQT1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Mri1Q9CQT1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mri1Q9CQT1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mri1Q9CQT1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mri1Q9CQT1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mri1Q9CQT1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mri1Q9CQT1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mri1Q9CQT1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mri1Q9CQT1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mri1Q9CQT1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mri1Q9CQT1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mri1Q9CQT1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mri1Q9CQT1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mri1Q9CQT1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mri1Q9CQT1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mri1Q9CQT1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mri1Q9CQT1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mri1Q9CQT1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mri1Q9CQT1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mri1Q9CQT1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mri1Q9CQT1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mri1Q9CQT1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mri1Q9CQT1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mri1Q9CQT1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mri1Q9CQT1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mri1Q9CQT1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Mri1Q9CQT1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mri1Q9CQT1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mri1Q9CQT1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mri1Q9CQT1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mri1Q9CQT1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mri1Q9CQT1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mri1Q9CQT1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mri1Q9CQT1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mri1Q9CQT1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mri1Q9CQT1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mri1Q9CQT1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mri1Q9CQT1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mri1Q9CQT1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mri1Q9CQT1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Mri1Q9CQT1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mri1Q9CQT1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mri1Q9CQT1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mri1Q9CQT1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mri1Q9CQT1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mri1Q9CQT1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mri1Q9CQT1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mri1Q9CQT1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mri1Q9CQT1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mri1Q9CQT1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mri1Q9CQT1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mri1Q9CQT1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mri1Q9CQT1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mri1Q9CQT1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mri1Q9CQT1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mri1Q9CQT1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mri1Q9CQT1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mri1Q9CQT1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mri1Q9CQT1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mri1Q9CQT1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mri1Q9CQT1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mri1Q9CQT1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms