Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM2

Kdelr2, ER lumen protein-retaining receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr2Q9CQM2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdelr2Q9CQM2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdelr2Q9CQM2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdelr2Q9CQM2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdelr2Q9CQM2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdelr2Q9CQM2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdelr2Q9CQM2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdelr2Q9CQM2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdelr2Q9CQM2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdelr2Q9CQM2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdelr2Q9CQM2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdelr2Q9CQM2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdelr2Q9CQM2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdelr2Q9CQM2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdelr2Q9CQM2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdelr2Q9CQM2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdelr2Q9CQM2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdelr2Q9CQM2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdelr2Q9CQM2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdelr2Q9CQM2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdelr2Q9CQM2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kdelr2Q9CQM2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kdelr2Q9CQM2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdelr2Q9CQM2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdelr2Q9CQM2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdelr2Q9CQM2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdelr2Q9CQM2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdelr2Q9CQM2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdelr2Q9CQM2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdelr2Q9CQM2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdelr2Q9CQM2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdelr2Q9CQM2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdelr2Q9CQM2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdelr2Q9CQM2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdelr2Q9CQM2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdelr2Q9CQM2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdelr2Q9CQM2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdelr2Q9CQM2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdelr2Q9CQM2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdelr2Q9CQM2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdelr2Q9CQM2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdelr2Q9CQM2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdelr2Q9CQM2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdelr2Q9CQM2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdelr2Q9CQM2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdelr2Q9CQM2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kdelr2Q9CQM2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdelr2Q9CQM2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdelr2Q9CQM2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdelr2Q9CQM2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdelr2Q9CQM2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdelr2Q9CQM2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdelr2Q9CQM2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdelr2Q9CQM2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdelr2Q9CQM2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdelr2Q9CQM2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdelr2Q9CQM2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdelr2Q9CQM2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdelr2Q9CQM2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdelr2Q9CQM2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdelr2Q9CQM2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdelr2Q9CQM2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdelr2Q9CQM2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdelr2Q9CQM2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdelr2Q9CQM2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdelr2Q9CQM2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdelr2Q9CQM2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdelr2Q9CQM2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdelr2Q9CQM2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdelr2Q9CQM2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdelr2Q9CQM2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdelr2Q9CQM2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdelr2Q9CQM2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdelr2Q9CQM2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdelr2Q9CQM2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdelr2Q9CQM2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdelr2Q9CQM2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdelr2Q9CQM2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdelr2Q9CQM2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdelr2Q9CQM2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Kdelr2Q9CQM2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdelr2Q9CQM2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdelr2Q9CQM2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdelr2Q9CQM2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdelr2Q9CQM2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdelr2Q9CQM2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdelr2Q9CQM2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdelr2Q9CQM2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdelr2Q9CQM2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdelr2Q9CQM2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdelr2Q9CQM2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdelr2Q9CQM2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdelr2Q9CQM2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdelr2Q9CQM2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdelr2Q9CQM2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdelr2Q9CQM2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdelr2Q9CQM2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdelr2Q9CQM2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdelr2Q9CQM2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdelr2Q9CQM2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms