Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzk1ip1Q9CQH0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzk1ip1Q9CQH0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzk1ip1Q9CQH0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzk1ip1Q9CQH0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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