Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nipsnap3bQ9CQE1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Nipsnap3bQ9CQE1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nipsnap3bQ9CQE1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nipsnap3bQ9CQE1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms