Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab5aQ9CQD1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab5aQ9CQD1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab5aQ9CQD1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab5aQ9CQD1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab5aQ9CQD1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab5aQ9CQD1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab5aQ9CQD1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab5aQ9CQD1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab5aQ9CQD1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab5aQ9CQD1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab5aQ9CQD1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab5aQ9CQD1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab5aQ9CQD1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab5aQ9CQD1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab5aQ9CQD1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab5aQ9CQD1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab5aQ9CQD1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab5aQ9CQD1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab5aQ9CQD1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab5aQ9CQD1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab5aQ9CQD1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab5aQ9CQD1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab5aQ9CQD1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab5aQ9CQD1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab5aQ9CQD1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab5aQ9CQD1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab5aQ9CQD1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab5aQ9CQD1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab5aQ9CQD1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab5aQ9CQD1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab5aQ9CQD1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab5aQ9CQD1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab5aQ9CQD1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab5aQ9CQD1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab5aQ9CQD1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab5aQ9CQD1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rab5aQ9CQD1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rab5aQ9CQD1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rab5aQ9CQD1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rab5aQ9CQD1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rab5aQ9CQD1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rab5aQ9CQD1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rab5aQ9CQD1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rab5aQ9CQD1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rab5aQ9CQD1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rab5aQ9CQD1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rab5aQ9CQD1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rab5aQ9CQD1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rab5aQ9CQD1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rab5aQ9CQD1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rab5aQ9CQD1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rab5aQ9CQD1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rab5aQ9CQD1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rab5aQ9CQD1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rab5aQ9CQD1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rab5aQ9CQD1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rab5aQ9CQD1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rab5aQ9CQD1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rab5aQ9CQD1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rab5aQ9CQD1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rab5aQ9CQD1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rab5aQ9CQD1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rab5aQ9CQD1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rab5aQ9CQD1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rab5aQ9CQD1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rab5aQ9CQD1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rab5aQ9CQD1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab5aQ9CQD1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab5aQ9CQD1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab5aQ9CQD1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rab5aQ9CQD1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rab5aQ9CQD1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rab5aQ9CQD1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rab5aQ9CQD1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rab5aQ9CQD1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rab5aQ9CQD1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rab5aQ9CQD1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rab5aQ9CQD1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rab5aQ9CQD1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rab5aQ9CQD1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rab5aQ9CQD1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rab5aQ9CQD1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rab5aQ9CQD1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rab5aQ9CQD1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rab5aQ9CQD1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rab5aQ9CQD1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab5aQ9CQD1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab5aQ9CQD1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rab5aQ9CQD1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rab5aQ9CQD1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab5aQ9CQD1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab5aQ9CQD1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab5aQ9CQD1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab5aQ9CQD1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab5aQ9CQD1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab5aQ9CQD1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab5aQ9CQD1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms