Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC0

Tpbpb, Trophoblast-specific protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpbpbQ9CQC0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TpbpbQ9CQC0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TpbpbQ9CQC0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TpbpbQ9CQC0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TpbpbQ9CQC0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TpbpbQ9CQC0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TpbpbQ9CQC0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TpbpbQ9CQC0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TpbpbQ9CQC0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TpbpbQ9CQC0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TpbpbQ9CQC0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TpbpbQ9CQC0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TpbpbQ9CQC0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TpbpbQ9CQC0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TpbpbQ9CQC0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TpbpbQ9CQC0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TpbpbQ9CQC0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TpbpbQ9CQC0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TpbpbQ9CQC0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TpbpbQ9CQC0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TpbpbQ9CQC0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TpbpbQ9CQC0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TpbpbQ9CQC0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TpbpbQ9CQC0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TpbpbQ9CQC0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TpbpbQ9CQC0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TpbpbQ9CQC0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TpbpbQ9CQC0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TpbpbQ9CQC0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TpbpbQ9CQC0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TpbpbQ9CQC0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TpbpbQ9CQC0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TpbpbQ9CQC0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TpbpbQ9CQC0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TpbpbQ9CQC0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TpbpbQ9CQC0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TpbpbQ9CQC0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TpbpbQ9CQC0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TpbpbQ9CQC0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TpbpbQ9CQC0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TpbpbQ9CQC0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TpbpbQ9CQC0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TpbpbQ9CQC0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TpbpbQ9CQC0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TpbpbQ9CQC0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TpbpbQ9CQC0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TpbpbQ9CQC0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TpbpbQ9CQC0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TpbpbQ9CQC0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TpbpbQ9CQC0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TpbpbQ9CQC0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TpbpbQ9CQC0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TpbpbQ9CQC0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TpbpbQ9CQC0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TpbpbQ9CQC0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TpbpbQ9CQC0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TpbpbQ9CQC0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TpbpbQ9CQC0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TpbpbQ9CQC0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TpbpbQ9CQC0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TpbpbQ9CQC0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TpbpbQ9CQC0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TpbpbQ9CQC0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TpbpbQ9CQC0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TpbpbQ9CQC0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TpbpbQ9CQC0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TpbpbQ9CQC0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TpbpbQ9CQC0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TpbpbQ9CQC0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TpbpbQ9CQC0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TpbpbQ9CQC0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TpbpbQ9CQC0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TpbpbQ9CQC0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TpbpbQ9CQC0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TpbpbQ9CQC0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TpbpbQ9CQC0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TpbpbQ9CQC0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TpbpbQ9CQC0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TpbpbQ9CQC0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TpbpbQ9CQC0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TpbpbQ9CQC0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TpbpbQ9CQC0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TpbpbQ9CQC0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TpbpbQ9CQC0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TpbpbQ9CQC0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TpbpbQ9CQC0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TpbpbQ9CQC0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TpbpbQ9CQC0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TpbpbQ9CQC0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TpbpbQ9CQC0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TpbpbQ9CQC0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TpbpbQ9CQC0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TpbpbQ9CQC0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TpbpbQ9CQC0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TpbpbQ9CQC0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TpbpbQ9CQC0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TpbpbQ9CQC0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TpbpbQ9CQC0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TpbpbQ9CQC0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TpbpbQ9CQC0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms