Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nudcd2Q9CQ48 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nudcd2Q9CQ48 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nudcd2Q9CQ48 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nudcd2Q9CQ48 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nudcd2Q9CQ48 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nudcd2Q9CQ48 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nudcd2Q9CQ48 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nudcd2Q9CQ48 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nudcd2Q9CQ48 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nudcd2Q9CQ48 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nudcd2Q9CQ48 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nudcd2Q9CQ48 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nudcd2Q9CQ48 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nudcd2Q9CQ48 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nudcd2Q9CQ48 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nudcd2Q9CQ48 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nudcd2Q9CQ48 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nudcd2Q9CQ48 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nudcd2Q9CQ48 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nudcd2Q9CQ48 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nudcd2Q9CQ48 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nudcd2Q9CQ48 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nudcd2Q9CQ48 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nudcd2Q9CQ48 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nudcd2Q9CQ48 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nudcd2Q9CQ48 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nudcd2Q9CQ48 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nudcd2Q9CQ48 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nudcd2Q9CQ48 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nudcd2Q9CQ48 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nudcd2Q9CQ48 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nudcd2Q9CQ48 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nudcd2Q9CQ48 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nudcd2Q9CQ48 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nudcd2Q9CQ48 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nudcd2Q9CQ48 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nudcd2Q9CQ48 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nudcd2Q9CQ48 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nudcd2Q9CQ48 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nudcd2Q9CQ48 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nudcd2Q9CQ48 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nudcd2Q9CQ48 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nudcd2Q9CQ48 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nudcd2Q9CQ48 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nudcd2Q9CQ48 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nudcd2Q9CQ48 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nudcd2Q9CQ48 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nudcd2Q9CQ48 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nudcd2Q9CQ48 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nudcd2Q9CQ48 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nudcd2Q9CQ48 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nudcd2Q9CQ48 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nudcd2Q9CQ48 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nudcd2Q9CQ48 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nudcd2Q9CQ48 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nudcd2Q9CQ48 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nudcd2Q9CQ48 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nudcd2Q9CQ48 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nudcd2Q9CQ48 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nudcd2Q9CQ48 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nudcd2Q9CQ48 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nudcd2Q9CQ48 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nudcd2Q9CQ48 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nudcd2Q9CQ48 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nudcd2Q9CQ48 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nudcd2Q9CQ48 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nudcd2Q9CQ48 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nudcd2Q9CQ48 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nudcd2Q9CQ48 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nudcd2Q9CQ48 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nudcd2Q9CQ48 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nudcd2Q9CQ48 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nudcd2Q9CQ48 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nudcd2Q9CQ48 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nudcd2Q9CQ48 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nudcd2Q9CQ48 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nudcd2Q9CQ48 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nudcd2Q9CQ48 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nudcd2Q9CQ48 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nudcd2Q9CQ48 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nudcd2Q9CQ48 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nudcd2Q9CQ48 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nudcd2Q9CQ48 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nudcd2Q9CQ48 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nudcd2Q9CQ48 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nudcd2Q9CQ48 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nudcd2Q9CQ48 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nudcd2Q9CQ48 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nudcd2Q9CQ48 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nudcd2Q9CQ48 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nudcd2Q9CQ48 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nudcd2Q9CQ48 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nudcd2Q9CQ48 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nudcd2Q9CQ48 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nudcd2Q9CQ48 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nudcd2Q9CQ48 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nudcd2Q9CQ48 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nudcd2Q9CQ48 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nudcd2Q9CQ48 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms