Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX8

Uqcr11, Cytochrome b-c1 complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uqcr11Q9CPX8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Uqcr11Q9CPX8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Uqcr11Q9CPX8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Uqcr11Q9CPX8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Uqcr11Q9CPX8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Uqcr11Q9CPX8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Uqcr11Q9CPX8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Uqcr11Q9CPX8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Uqcr11Q9CPX8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Uqcr11Q9CPX8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Uqcr11Q9CPX8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Uqcr11Q9CPX8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Uqcr11Q9CPX8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Uqcr11Q9CPX8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Uqcr11Q9CPX8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Uqcr11Q9CPX8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uqcr11Q9CPX8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uqcr11Q9CPX8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uqcr11Q9CPX8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uqcr11Q9CPX8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uqcr11Q9CPX8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uqcr11Q9CPX8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Uqcr11Q9CPX8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Uqcr11Q9CPX8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Uqcr11Q9CPX8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Uqcr11Q9CPX8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Uqcr11Q9CPX8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Uqcr11Q9CPX8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Uqcr11Q9CPX8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Uqcr11Q9CPX8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uqcr11Q9CPX8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uqcr11Q9CPX8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Uqcr11Q9CPX8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uqcr11Q9CPX8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uqcr11Q9CPX8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uqcr11Q9CPX8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uqcr11Q9CPX8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uqcr11Q9CPX8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Uqcr11Q9CPX8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uqcr11Q9CPX8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uqcr11Q9CPX8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Uqcr11Q9CPX8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uqcr11Q9CPX8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uqcr11Q9CPX8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uqcr11Q9CPX8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uqcr11Q9CPX8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uqcr11Q9CPX8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uqcr11Q9CPX8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uqcr11Q9CPX8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uqcr11Q9CPX8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uqcr11Q9CPX8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uqcr11Q9CPX8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uqcr11Q9CPX8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uqcr11Q9CPX8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uqcr11Q9CPX8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Uqcr11Q9CPX8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Uqcr11Q9CPX8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Uqcr11Q9CPX8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Uqcr11Q9CPX8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Uqcr11Q9CPX8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Uqcr11Q9CPX8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Uqcr11Q9CPX8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uqcr11Q9CPX8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uqcr11Q9CPX8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uqcr11Q9CPX8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uqcr11Q9CPX8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uqcr11Q9CPX8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uqcr11Q9CPX8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uqcr11Q9CPX8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uqcr11Q9CPX8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uqcr11Q9CPX8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uqcr11Q9CPX8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uqcr11Q9CPX8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uqcr11Q9CPX8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uqcr11Q9CPX8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uqcr11Q9CPX8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Uqcr11Q9CPX8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Uqcr11Q9CPX8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Uqcr11Q9CPX8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Uqcr11Q9CPX8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Uqcr11Q9CPX8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Uqcr11Q9CPX8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uqcr11Q9CPX8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uqcr11Q9CPX8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uqcr11Q9CPX8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uqcr11Q9CPX8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uqcr11Q9CPX8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uqcr11Q9CPX8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uqcr11Q9CPX8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uqcr11Q9CPX8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uqcr11Q9CPX8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uqcr11Q9CPX8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uqcr11Q9CPX8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Uqcr11Q9CPX8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uqcr11Q9CPX8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uqcr11Q9CPX8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Uqcr11Q9CPX8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Uqcr11Q9CPX8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Uqcr11Q9CPX8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Uqcr11Q9CPX8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms