Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Bcl11bQ99PV8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Bcl11bQ99PV8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Bcl11bQ99PV8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Bcl11bQ99PV8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Bcl11bQ99PV8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Bcl11bQ99PV8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Bcl11bQ99PV8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
Bcl11bQ99PV8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Bcl11bQ99PV8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Bcl11bQ99PV8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Bcl11bQ99PV8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Bcl11bQ99PV8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Bcl11bQ99PV8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Bcl11bQ99PV8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
Bcl11bQ99PV8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
Bcl11bQ99PV8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Bcl11bQ99PV8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Bcl11bQ99PV8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Bcl11bQ99PV8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Bcl11bQ99PV8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Bcl11bQ99PV8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Bcl11bQ99PV8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Bcl11bQ99PV8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Bcl11bQ99PV8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Bcl11bQ99PV8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Bcl11bQ99PV8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Bcl11bQ99PV8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Bcl11bQ99PV8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Bcl11bQ99PV8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Bcl11bQ99PV8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Bcl11bQ99PV8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Bcl11bQ99PV8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Bcl11bQ99PV8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Bcl11bQ99PV8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Bcl11bQ99PV8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Bcl11bQ99PV8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Bcl11bQ99PV8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Bcl11bQ99PV8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Bcl11bQ99PV8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Bcl11bQ99PV8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Bcl11bQ99PV8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Bcl11bQ99PV8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Bcl11bQ99PV8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Bcl11bQ99PV8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Bcl11bQ99PV8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Bcl11bQ99PV8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Bcl11bQ99PV8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Bcl11bQ99PV8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
Bcl11bQ99PV8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Bcl11bQ99PV8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Bcl11bQ99PV8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Bcl11bQ99PV8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Bcl11bQ99PV8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Bcl11bQ99PV8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Bcl11bQ99PV8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Bcl11bQ99PV8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Bcl11bQ99PV8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Bcl11bQ99PV8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Bcl11bQ99PV8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Bcl11bQ99PV8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Bcl11bQ99PV8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Bcl11bQ99PV8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Bcl11bQ99PV8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Bcl11bQ99PV8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Bcl11bQ99PV8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Bcl11bQ99PV8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Bcl11bQ99PV8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
Bcl11bQ99PV8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Bcl11bQ99PV8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Bcl11bQ99PV8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Bcl11bQ99PV8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Bcl11bQ99PV8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Bcl11bQ99PV8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Bcl11bQ99PV8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Bcl11bQ99PV8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Bcl11bQ99PV8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Bcl11bQ99PV8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Bcl11bQ99PV8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
Bcl11bQ99PV8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Bcl11bQ99PV8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Bcl11bQ99PV8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Bcl11bQ99PV8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Bcl11bQ99PV8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Bcl11bQ99PV8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Bcl11bQ99PV8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
Bcl11bQ99PV8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Bcl11bQ99PV8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Bcl11bQ99PV8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Bcl11bQ99PV8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Bcl11bQ99PV8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Bcl11bQ99PV8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Bcl11bQ99PV8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Bcl11bQ99PV8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Bcl11bQ99PV8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Bcl11bQ99PV8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Bcl11bQ99PV8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Bcl11bQ99PV8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Bcl11bQ99PV8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Bcl11bQ99PV8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 218.7 ms