Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,54■■■□□ 2
Cntnap4Q99P47 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27,53■■■□□ 2
Cntnap4Q99P47 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Cntnap4Q99P47 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Cntnap4Q99P47 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Cntnap4Q99P47 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Cntnap4Q99P47 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Cntnap4Q99P47 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Cntnap4Q99P47 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Cntnap4Q99P47 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Cntnap4Q99P47 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Cntnap4Q99P47 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Cntnap4Q99P47 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Cntnap4Q99P47 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Cntnap4Q99P47 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Cntnap4Q99P47 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Cntnap4Q99P47 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Cntnap4Q99P47 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Cntnap4Q99P47 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27,42■■□□□ 1,98
Cntnap4Q99P47 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Cntnap4Q99P47 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Cntnap4Q99P47 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Cntnap4Q99P47 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Cntnap4Q99P47 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
Cntnap4Q99P47 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Cntnap4Q99P47 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27,36■■□□□ 1,97
Cntnap4Q99P47 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Cntnap4Q99P47 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Cntnap4Q99P47 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Cntnap4Q99P47 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Cntnap4Q99P47 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Cntnap4Q99P47 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Cntnap4Q99P47 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Cntnap4Q99P47 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27,33■■□□□ 1,96
Cntnap4Q99P47 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Cntnap4Q99P47 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Cntnap4Q99P47 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Cntnap4Q99P47 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Cntnap4Q99P47 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Cntnap4Q99P47 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Cntnap4Q99P47 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Cntnap4Q99P47 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Cntnap4Q99P47 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Cntnap4Q99P47 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Cntnap4Q99P47 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Cntnap4Q99P47 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Cntnap4Q99P47 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Cntnap4Q99P47 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Cntnap4Q99P47 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Cntnap4Q99P47 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Cntnap4Q99P47 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Cntnap4Q99P47 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27,24■■□□□ 1,95
Cntnap4Q99P47 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Cntnap4Q99P47 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,24■■□□□ 1,95
Cntnap4Q99P47 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Cntnap4Q99P47 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Cntnap4Q99P47 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Cntnap4Q99P47 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Cntnap4Q99P47 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,21■■□□□ 1,95
Cntnap4Q99P47 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Cntnap4Q99P47 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Cntnap4Q99P47 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27,17■■□□□ 1,94
Cntnap4Q99P47 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Cntnap4Q99P47 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Cntnap4Q99P47 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Cntnap4Q99P47 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Cntnap4Q99P47 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Cntnap4Q99P47 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Cntnap4Q99P47 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Cntnap4Q99P47 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Cntnap4Q99P47 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Cntnap4Q99P47 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27,09■■□□□ 1,93
Cntnap4Q99P47 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Cntnap4Q99P47 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Cntnap4Q99P47 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Cntnap4Q99P47 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Cntnap4Q99P47 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Cntnap4Q99P47 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Cntnap4Q99P47 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27,05■■□□□ 1,92
Cntnap4Q99P47 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Cntnap4Q99P47 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Cntnap4Q99P47 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Cntnap4Q99P47 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Cntnap4Q99P47 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Cntnap4Q99P47 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Cntnap4Q99P47 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Cntnap4Q99P47 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1,91
Cntnap4Q99P47 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1,91
Cntnap4Q99P47 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1,91
Cntnap4Q99P47 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Cntnap4Q99P47 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Cntnap4Q99P47 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,98■■□□□ 1,91
Cntnap4Q99P47 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Cntnap4Q99P47 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26,95■■□□□ 1,91
Cntnap4Q99P47 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Cntnap4Q99P47 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Cntnap4Q99P47 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Cntnap4Q99P47 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Cntnap4Q99P47 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Cntnap4Q99P47 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28,4 ms