Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sf3b1Q99NB9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sf3b1Q99NB9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sf3b1Q99NB9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sf3b1Q99NB9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sf3b1Q99NB9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sf3b1Q99NB9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sf3b1Q99NB9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sf3b1Q99NB9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sf3b1Q99NB9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sf3b1Q99NB9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sf3b1Q99NB9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sf3b1Q99NB9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sf3b1Q99NB9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sf3b1Q99NB9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sf3b1Q99NB9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sf3b1Q99NB9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sf3b1Q99NB9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sf3b1Q99NB9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sf3b1Q99NB9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sf3b1Q99NB9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sf3b1Q99NB9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Sf3b1Q99NB9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sf3b1Q99NB9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sf3b1Q99NB9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sf3b1Q99NB9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Sf3b1Q99NB9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sf3b1Q99NB9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sf3b1Q99NB9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sf3b1Q99NB9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sf3b1Q99NB9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sf3b1Q99NB9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sf3b1Q99NB9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sf3b1Q99NB9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sf3b1Q99NB9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sf3b1Q99NB9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sf3b1Q99NB9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sf3b1Q99NB9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sf3b1Q99NB9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sf3b1Q99NB9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sf3b1Q99NB9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sf3b1Q99NB9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sf3b1Q99NB9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sf3b1Q99NB9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sf3b1Q99NB9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sf3b1Q99NB9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Sf3b1Q99NB9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sf3b1Q99NB9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sf3b1Q99NB9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sf3b1Q99NB9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Sf3b1Q99NB9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sf3b1Q99NB9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sf3b1Q99NB9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sf3b1Q99NB9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sf3b1Q99NB9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sf3b1Q99NB9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Sf3b1Q99NB9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sf3b1Q99NB9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sf3b1Q99NB9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sf3b1Q99NB9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sf3b1Q99NB9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sf3b1Q99NB9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sf3b1Q99NB9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sf3b1Q99NB9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sf3b1Q99NB9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sf3b1Q99NB9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sf3b1Q99NB9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sf3b1Q99NB9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sf3b1Q99NB9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sf3b1Q99NB9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sf3b1Q99NB9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sf3b1Q99NB9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sf3b1Q99NB9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sf3b1Q99NB9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sf3b1Q99NB9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sf3b1Q99NB9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sf3b1Q99NB9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sf3b1Q99NB9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sf3b1Q99NB9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sf3b1Q99NB9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Sf3b1Q99NB9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sf3b1Q99NB9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sf3b1Q99NB9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sf3b1Q99NB9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sf3b1Q99NB9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sf3b1Q99NB9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sf3b1Q99NB9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Sf3b1Q99NB9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sf3b1Q99NB9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Sf3b1Q99NB9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sf3b1Q99NB9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sf3b1Q99NB9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sf3b1Q99NB9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sf3b1Q99NB9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sf3b1Q99NB9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sf3b1Q99NB9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sf3b1Q99NB9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sf3b1Q99NB9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sf3b1Q99NB9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms