Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB5

Gsdmc, Gasdermin-C, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GsdmcQ99NB5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GsdmcQ99NB5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GsdmcQ99NB5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GsdmcQ99NB5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GsdmcQ99NB5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GsdmcQ99NB5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GsdmcQ99NB5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GsdmcQ99NB5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GsdmcQ99NB5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GsdmcQ99NB5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GsdmcQ99NB5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GsdmcQ99NB5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GsdmcQ99NB5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GsdmcQ99NB5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GsdmcQ99NB5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GsdmcQ99NB5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GsdmcQ99NB5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GsdmcQ99NB5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GsdmcQ99NB5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GsdmcQ99NB5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GsdmcQ99NB5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GsdmcQ99NB5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GsdmcQ99NB5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GsdmcQ99NB5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GsdmcQ99NB5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GsdmcQ99NB5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GsdmcQ99NB5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GsdmcQ99NB5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GsdmcQ99NB5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GsdmcQ99NB5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GsdmcQ99NB5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GsdmcQ99NB5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GsdmcQ99NB5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GsdmcQ99NB5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GsdmcQ99NB5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GsdmcQ99NB5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GsdmcQ99NB5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GsdmcQ99NB5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GsdmcQ99NB5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GsdmcQ99NB5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GsdmcQ99NB5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GsdmcQ99NB5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GsdmcQ99NB5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GsdmcQ99NB5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GsdmcQ99NB5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GsdmcQ99NB5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GsdmcQ99NB5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GsdmcQ99NB5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GsdmcQ99NB5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GsdmcQ99NB5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GsdmcQ99NB5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GsdmcQ99NB5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GsdmcQ99NB5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GsdmcQ99NB5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GsdmcQ99NB5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GsdmcQ99NB5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GsdmcQ99NB5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GsdmcQ99NB5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GsdmcQ99NB5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GsdmcQ99NB5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GsdmcQ99NB5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GsdmcQ99NB5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GsdmcQ99NB5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GsdmcQ99NB5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GsdmcQ99NB5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GsdmcQ99NB5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GsdmcQ99NB5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GsdmcQ99NB5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GsdmcQ99NB5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GsdmcQ99NB5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GsdmcQ99NB5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GsdmcQ99NB5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GsdmcQ99NB5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GsdmcQ99NB5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GsdmcQ99NB5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GsdmcQ99NB5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GsdmcQ99NB5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GsdmcQ99NB5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GsdmcQ99NB5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GsdmcQ99NB5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GsdmcQ99NB5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GsdmcQ99NB5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GsdmcQ99NB5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GsdmcQ99NB5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GsdmcQ99NB5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GsdmcQ99NB5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GsdmcQ99NB5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GsdmcQ99NB5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GsdmcQ99NB5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GsdmcQ99NB5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GsdmcQ99NB5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GsdmcQ99NB5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GsdmcQ99NB5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GsdmcQ99NB5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GsdmcQ99NB5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GsdmcQ99NB5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GsdmcQ99NB5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GsdmcQ99NB5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GsdmcQ99NB5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GsdmcQ99NB5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms