Protein–RNA interactions for Protein: Q99MJ6

Pdzd3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd3Q99MJ6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Pdzd3Q99MJ6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pdzd3Q99MJ6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pdzd3Q99MJ6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pdzd3Q99MJ6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Pdzd3Q99MJ6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pdzd3Q99MJ6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pdzd3Q99MJ6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pdzd3Q99MJ6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pdzd3Q99MJ6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pdzd3Q99MJ6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pdzd3Q99MJ6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pdzd3Q99MJ6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pdzd3Q99MJ6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pdzd3Q99MJ6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pdzd3Q99MJ6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pdzd3Q99MJ6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pdzd3Q99MJ6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pdzd3Q99MJ6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pdzd3Q99MJ6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pdzd3Q99MJ6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pdzd3Q99MJ6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pdzd3Q99MJ6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pdzd3Q99MJ6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pdzd3Q99MJ6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdzd3Q99MJ6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdzd3Q99MJ6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Pdzd3Q99MJ6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Pdzd3Q99MJ6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pdzd3Q99MJ6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pdzd3Q99MJ6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pdzd3Q99MJ6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdzd3Q99MJ6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdzd3Q99MJ6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdzd3Q99MJ6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdzd3Q99MJ6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdzd3Q99MJ6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pdzd3Q99MJ6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pdzd3Q99MJ6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pdzd3Q99MJ6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pdzd3Q99MJ6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pdzd3Q99MJ6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pdzd3Q99MJ6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pdzd3Q99MJ6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pdzd3Q99MJ6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pdzd3Q99MJ6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pdzd3Q99MJ6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Pdzd3Q99MJ6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdzd3Q99MJ6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdzd3Q99MJ6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdzd3Q99MJ6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Pdzd3Q99MJ6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pdzd3Q99MJ6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdzd3Q99MJ6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pdzd3Q99MJ6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pdzd3Q99MJ6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pdzd3Q99MJ6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pdzd3Q99MJ6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Pdzd3Q99MJ6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pdzd3Q99MJ6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pdzd3Q99MJ6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdzd3Q99MJ6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdzd3Q99MJ6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pdzd3Q99MJ6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pdzd3Q99MJ6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pdzd3Q99MJ6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pdzd3Q99MJ6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdzd3Q99MJ6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdzd3Q99MJ6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdzd3Q99MJ6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdzd3Q99MJ6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdzd3Q99MJ6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdzd3Q99MJ6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pdzd3Q99MJ6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pdzd3Q99MJ6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pdzd3Q99MJ6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdzd3Q99MJ6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdzd3Q99MJ6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdzd3Q99MJ6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdzd3Q99MJ6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdzd3Q99MJ6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdzd3Q99MJ6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdzd3Q99MJ6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdzd3Q99MJ6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdzd3Q99MJ6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdzd3Q99MJ6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pdzd3Q99MJ6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pdzd3Q99MJ6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pdzd3Q99MJ6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pdzd3Q99MJ6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdzd3Q99MJ6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdzd3Q99MJ6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdzd3Q99MJ6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdzd3Q99MJ6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pdzd3Q99MJ6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdzd3Q99MJ6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pdzd3Q99MJ6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pdzd3Q99MJ6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Pdzd3Q99MJ6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pdzd3Q99MJ6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms