Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gtpbp4Q99ME9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gtpbp4Q99ME9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Gtpbp4Q99ME9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gtpbp4Q99ME9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gtpbp4Q99ME9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gtpbp4Q99ME9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gtpbp4Q99ME9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gtpbp4Q99ME9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gtpbp4Q99ME9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gtpbp4Q99ME9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gtpbp4Q99ME9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gtpbp4Q99ME9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gtpbp4Q99ME9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gtpbp4Q99ME9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gtpbp4Q99ME9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gtpbp4Q99ME9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gtpbp4Q99ME9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gtpbp4Q99ME9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gtpbp4Q99ME9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gtpbp4Q99ME9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gtpbp4Q99ME9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gtpbp4Q99ME9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gtpbp4Q99ME9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Gtpbp4Q99ME9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gtpbp4Q99ME9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gtpbp4Q99ME9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gtpbp4Q99ME9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gtpbp4Q99ME9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gtpbp4Q99ME9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gtpbp4Q99ME9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gtpbp4Q99ME9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gtpbp4Q99ME9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gtpbp4Q99ME9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gtpbp4Q99ME9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gtpbp4Q99ME9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gtpbp4Q99ME9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Gtpbp4Q99ME9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gtpbp4Q99ME9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gtpbp4Q99ME9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gtpbp4Q99ME9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gtpbp4Q99ME9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gtpbp4Q99ME9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gtpbp4Q99ME9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gtpbp4Q99ME9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Gtpbp4Q99ME9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Gtpbp4Q99ME9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gtpbp4Q99ME9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gtpbp4Q99ME9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gtpbp4Q99ME9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gtpbp4Q99ME9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gtpbp4Q99ME9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gtpbp4Q99ME9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gtpbp4Q99ME9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gtpbp4Q99ME9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gtpbp4Q99ME9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gtpbp4Q99ME9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gtpbp4Q99ME9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gtpbp4Q99ME9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gtpbp4Q99ME9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Gtpbp4Q99ME9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Gtpbp4Q99ME9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gtpbp4Q99ME9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gtpbp4Q99ME9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gtpbp4Q99ME9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gtpbp4Q99ME9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gtpbp4Q99ME9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gtpbp4Q99ME9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gtpbp4Q99ME9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gtpbp4Q99ME9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gtpbp4Q99ME9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gtpbp4Q99ME9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Gtpbp4Q99ME9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtpbp4Q99ME9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtpbp4Q99ME9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gtpbp4Q99ME9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gtpbp4Q99ME9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gtpbp4Q99ME9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gtpbp4Q99ME9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gtpbp4Q99ME9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Gtpbp4Q99ME9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gtpbp4Q99ME9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gtpbp4Q99ME9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gtpbp4Q99ME9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gtpbp4Q99ME9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtpbp4Q99ME9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtpbp4Q99ME9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gtpbp4Q99ME9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gtpbp4Q99ME9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gtpbp4Q99ME9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gtpbp4Q99ME9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gtpbp4Q99ME9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gtpbp4Q99ME9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gtpbp4Q99ME9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gtpbp4Q99ME9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gtpbp4Q99ME9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gtpbp4Q99ME9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gtpbp4Q99ME9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gtpbp4Q99ME9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtpbp4Q99ME9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms