Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tlr3Q99MB1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tlr3Q99MB1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tlr3Q99MB1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tlr3Q99MB1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tlr3Q99MB1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tlr3Q99MB1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tlr3Q99MB1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tlr3Q99MB1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tlr3Q99MB1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tlr3Q99MB1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tlr3Q99MB1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tlr3Q99MB1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Tlr3Q99MB1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tlr3Q99MB1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Tlr3Q99MB1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tlr3Q99MB1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Tlr3Q99MB1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tlr3Q99MB1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tlr3Q99MB1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Tlr3Q99MB1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tlr3Q99MB1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tlr3Q99MB1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tlr3Q99MB1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tlr3Q99MB1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tlr3Q99MB1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tlr3Q99MB1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tlr3Q99MB1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tlr3Q99MB1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tlr3Q99MB1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tlr3Q99MB1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tlr3Q99MB1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tlr3Q99MB1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Tlr3Q99MB1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tlr3Q99MB1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tlr3Q99MB1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tlr3Q99MB1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tlr3Q99MB1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tlr3Q99MB1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tlr3Q99MB1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tlr3Q99MB1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tlr3Q99MB1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tlr3Q99MB1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tlr3Q99MB1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tlr3Q99MB1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tlr3Q99MB1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Tlr3Q99MB1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Tlr3Q99MB1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tlr3Q99MB1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tlr3Q99MB1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tlr3Q99MB1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tlr3Q99MB1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Tlr3Q99MB1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tlr3Q99MB1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tlr3Q99MB1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tlr3Q99MB1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tlr3Q99MB1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tlr3Q99MB1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tlr3Q99MB1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tlr3Q99MB1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tlr3Q99MB1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tlr3Q99MB1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Tlr3Q99MB1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tlr3Q99MB1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tlr3Q99MB1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tlr3Q99MB1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tlr3Q99MB1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tlr3Q99MB1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tlr3Q99MB1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tlr3Q99MB1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Tlr3Q99MB1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tlr3Q99MB1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tlr3Q99MB1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tlr3Q99MB1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tlr3Q99MB1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tlr3Q99MB1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tlr3Q99MB1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tlr3Q99MB1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tlr3Q99MB1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tlr3Q99MB1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tlr3Q99MB1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tlr3Q99MB1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tlr3Q99MB1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tlr3Q99MB1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tlr3Q99MB1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tlr3Q99MB1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tlr3Q99MB1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tlr3Q99MB1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tlr3Q99MB1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tlr3Q99MB1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tlr3Q99MB1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tlr3Q99MB1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tlr3Q99MB1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Tlr3Q99MB1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tlr3Q99MB1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tlr3Q99MB1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tlr3Q99MB1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tlr3Q99MB1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Tlr3Q99MB1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tlr3Q99MB1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.5 ms