Protein–RNA interactions for Protein: Q99LS3

Psph, Phosphoserine phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsphQ99LS3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PsphQ99LS3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PsphQ99LS3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PsphQ99LS3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PsphQ99LS3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PsphQ99LS3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PsphQ99LS3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PsphQ99LS3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PsphQ99LS3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PsphQ99LS3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PsphQ99LS3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PsphQ99LS3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PsphQ99LS3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PsphQ99LS3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PsphQ99LS3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PsphQ99LS3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PsphQ99LS3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PsphQ99LS3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PsphQ99LS3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PsphQ99LS3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PsphQ99LS3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PsphQ99LS3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PsphQ99LS3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PsphQ99LS3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PsphQ99LS3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PsphQ99LS3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PsphQ99LS3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PsphQ99LS3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PsphQ99LS3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PsphQ99LS3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PsphQ99LS3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PsphQ99LS3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PsphQ99LS3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PsphQ99LS3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PsphQ99LS3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PsphQ99LS3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PsphQ99LS3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PsphQ99LS3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PsphQ99LS3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PsphQ99LS3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PsphQ99LS3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PsphQ99LS3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PsphQ99LS3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PsphQ99LS3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PsphQ99LS3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PsphQ99LS3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PsphQ99LS3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PsphQ99LS3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PsphQ99LS3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PsphQ99LS3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PsphQ99LS3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PsphQ99LS3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PsphQ99LS3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PsphQ99LS3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PsphQ99LS3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PsphQ99LS3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PsphQ99LS3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PsphQ99LS3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PsphQ99LS3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PsphQ99LS3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PsphQ99LS3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PsphQ99LS3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PsphQ99LS3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PsphQ99LS3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PsphQ99LS3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PsphQ99LS3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PsphQ99LS3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PsphQ99LS3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PsphQ99LS3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PsphQ99LS3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PsphQ99LS3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PsphQ99LS3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PsphQ99LS3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PsphQ99LS3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PsphQ99LS3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PsphQ99LS3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PsphQ99LS3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PsphQ99LS3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PsphQ99LS3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PsphQ99LS3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PsphQ99LS3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PsphQ99LS3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PsphQ99LS3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PsphQ99LS3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PsphQ99LS3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PsphQ99LS3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PsphQ99LS3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PsphQ99LS3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PsphQ99LS3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PsphQ99LS3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PsphQ99LS3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PsphQ99LS3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PsphQ99LS3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PsphQ99LS3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PsphQ99LS3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PsphQ99LS3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PsphQ99LS3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PsphQ99LS3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PsphQ99LS3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PsphQ99LS3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms