Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cttnbp2nlQ99LJ0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cttnbp2nlQ99LJ0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cttnbp2nlQ99LJ0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cttnbp2nlQ99LJ0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cttnbp2nlQ99LJ0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cttnbp2nlQ99LJ0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cttnbp2nlQ99LJ0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cttnbp2nlQ99LJ0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cttnbp2nlQ99LJ0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cttnbp2nlQ99LJ0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cttnbp2nlQ99LJ0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cttnbp2nlQ99LJ0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cttnbp2nlQ99LJ0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cttnbp2nlQ99LJ0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cttnbp2nlQ99LJ0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cttnbp2nlQ99LJ0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cttnbp2nlQ99LJ0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cttnbp2nlQ99LJ0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cttnbp2nlQ99LJ0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cttnbp2nlQ99LJ0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cttnbp2nlQ99LJ0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cttnbp2nlQ99LJ0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cttnbp2nlQ99LJ0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cttnbp2nlQ99LJ0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cttnbp2nlQ99LJ0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cttnbp2nlQ99LJ0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cttnbp2nlQ99LJ0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cttnbp2nlQ99LJ0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cttnbp2nlQ99LJ0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cttnbp2nlQ99LJ0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cttnbp2nlQ99LJ0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cttnbp2nlQ99LJ0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cttnbp2nlQ99LJ0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cttnbp2nlQ99LJ0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cttnbp2nlQ99LJ0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cttnbp2nlQ99LJ0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cttnbp2nlQ99LJ0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms