Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU1

Dhdds, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Dhdds, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhddsQ99KU1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DhddsQ99KU1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DhddsQ99KU1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DhddsQ99KU1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DhddsQ99KU1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DhddsQ99KU1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DhddsQ99KU1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DhddsQ99KU1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DhddsQ99KU1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DhddsQ99KU1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DhddsQ99KU1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DhddsQ99KU1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DhddsQ99KU1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DhddsQ99KU1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DhddsQ99KU1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DhddsQ99KU1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DhddsQ99KU1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DhddsQ99KU1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DhddsQ99KU1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DhddsQ99KU1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DhddsQ99KU1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DhddsQ99KU1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DhddsQ99KU1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DhddsQ99KU1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DhddsQ99KU1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DhddsQ99KU1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DhddsQ99KU1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DhddsQ99KU1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DhddsQ99KU1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DhddsQ99KU1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DhddsQ99KU1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DhddsQ99KU1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DhddsQ99KU1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DhddsQ99KU1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DhddsQ99KU1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DhddsQ99KU1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DhddsQ99KU1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DhddsQ99KU1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DhddsQ99KU1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DhddsQ99KU1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DhddsQ99KU1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DhddsQ99KU1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DhddsQ99KU1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DhddsQ99KU1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DhddsQ99KU1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DhddsQ99KU1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DhddsQ99KU1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DhddsQ99KU1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DhddsQ99KU1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DhddsQ99KU1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DhddsQ99KU1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DhddsQ99KU1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DhddsQ99KU1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DhddsQ99KU1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DhddsQ99KU1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DhddsQ99KU1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DhddsQ99KU1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
DhddsQ99KU1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DhddsQ99KU1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DhddsQ99KU1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DhddsQ99KU1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DhddsQ99KU1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DhddsQ99KU1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DhddsQ99KU1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DhddsQ99KU1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DhddsQ99KU1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DhddsQ99KU1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DhddsQ99KU1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DhddsQ99KU1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DhddsQ99KU1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DhddsQ99KU1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DhddsQ99KU1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DhddsQ99KU1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DhddsQ99KU1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DhddsQ99KU1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DhddsQ99KU1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DhddsQ99KU1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DhddsQ99KU1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DhddsQ99KU1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DhddsQ99KU1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DhddsQ99KU1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DhddsQ99KU1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DhddsQ99KU1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DhddsQ99KU1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DhddsQ99KU1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DhddsQ99KU1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DhddsQ99KU1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DhddsQ99KU1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DhddsQ99KU1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DhddsQ99KU1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DhddsQ99KU1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DhddsQ99KU1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DhddsQ99KU1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DhddsQ99KU1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DhddsQ99KU1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DhddsQ99KU1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DhddsQ99KU1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DhddsQ99KU1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DhddsQ99KU1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DhddsQ99KU1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms