Protein–RNA interactions for Protein: Q99KI3

Emc3, ER membrane protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc3Q99KI3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Emc3Q99KI3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Emc3Q99KI3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Emc3Q99KI3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Emc3Q99KI3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Emc3Q99KI3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Emc3Q99KI3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Emc3Q99KI3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Emc3Q99KI3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Emc3Q99KI3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Emc3Q99KI3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Emc3Q99KI3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Emc3Q99KI3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Emc3Q99KI3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Emc3Q99KI3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Emc3Q99KI3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Emc3Q99KI3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Emc3Q99KI3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Emc3Q99KI3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Emc3Q99KI3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Emc3Q99KI3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Emc3Q99KI3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Emc3Q99KI3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Emc3Q99KI3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Emc3Q99KI3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Emc3Q99KI3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Emc3Q99KI3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Emc3Q99KI3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Emc3Q99KI3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Emc3Q99KI3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Emc3Q99KI3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Emc3Q99KI3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Emc3Q99KI3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Emc3Q99KI3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Emc3Q99KI3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Emc3Q99KI3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Emc3Q99KI3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Emc3Q99KI3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Emc3Q99KI3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Emc3Q99KI3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Emc3Q99KI3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Emc3Q99KI3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Emc3Q99KI3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Emc3Q99KI3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Emc3Q99KI3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Emc3Q99KI3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Emc3Q99KI3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Emc3Q99KI3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Emc3Q99KI3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Emc3Q99KI3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Emc3Q99KI3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Emc3Q99KI3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Emc3Q99KI3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Emc3Q99KI3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Emc3Q99KI3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Emc3Q99KI3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Emc3Q99KI3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Emc3Q99KI3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Emc3Q99KI3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Emc3Q99KI3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Emc3Q99KI3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Emc3Q99KI3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Emc3Q99KI3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Emc3Q99KI3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Emc3Q99KI3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Emc3Q99KI3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Emc3Q99KI3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Emc3Q99KI3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Emc3Q99KI3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Emc3Q99KI3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Emc3Q99KI3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Emc3Q99KI3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Emc3Q99KI3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Emc3Q99KI3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Emc3Q99KI3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Emc3Q99KI3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Emc3Q99KI3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Emc3Q99KI3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Emc3Q99KI3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Emc3Q99KI3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Emc3Q99KI3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Emc3Q99KI3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Emc3Q99KI3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Emc3Q99KI3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Emc3Q99KI3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Emc3Q99KI3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Emc3Q99KI3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Emc3Q99KI3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Emc3Q99KI3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Emc3Q99KI3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Emc3Q99KI3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Emc3Q99KI3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Emc3Q99KI3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Emc3Q99KI3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Emc3Q99KI3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Emc3Q99KI3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Emc3Q99KI3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Emc3Q99KI3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Emc3Q99KI3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Emc3Q99KI3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms