Protein–RNA interactions for Protein: Q99K01

Pdxdc1, Pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdxdc1Q99K01 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pdxdc1Q99K01 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pdxdc1Q99K01 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pdxdc1Q99K01 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pdxdc1Q99K01 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pdxdc1Q99K01 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pdxdc1Q99K01 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Pdxdc1Q99K01 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pdxdc1Q99K01 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pdxdc1Q99K01 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Pdxdc1Q99K01 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdxdc1Q99K01 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdxdc1Q99K01 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdxdc1Q99K01 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdxdc1Q99K01 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdxdc1Q99K01 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdxdc1Q99K01 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pdxdc1Q99K01 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pdxdc1Q99K01 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pdxdc1Q99K01 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pdxdc1Q99K01 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pdxdc1Q99K01 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pdxdc1Q99K01 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pdxdc1Q99K01 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pdxdc1Q99K01 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pdxdc1Q99K01 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pdxdc1Q99K01 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pdxdc1Q99K01 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pdxdc1Q99K01 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pdxdc1Q99K01 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdxdc1Q99K01 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pdxdc1Q99K01 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdxdc1Q99K01 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdxdc1Q99K01 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pdxdc1Q99K01 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pdxdc1Q99K01 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Pdxdc1Q99K01 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pdxdc1Q99K01 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pdxdc1Q99K01 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdxdc1Q99K01 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdxdc1Q99K01 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdxdc1Q99K01 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdxdc1Q99K01 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdxdc1Q99K01 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdxdc1Q99K01 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pdxdc1Q99K01 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pdxdc1Q99K01 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdxdc1Q99K01 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdxdc1Q99K01 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdxdc1Q99K01 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pdxdc1Q99K01 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pdxdc1Q99K01 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdxdc1Q99K01 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdxdc1Q99K01 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdxdc1Q99K01 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdxdc1Q99K01 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdxdc1Q99K01 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pdxdc1Q99K01 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pdxdc1Q99K01 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Pdxdc1Q99K01 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pdxdc1Q99K01 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdxdc1Q99K01 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdxdc1Q99K01 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdxdc1Q99K01 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdxdc1Q99K01 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdxdc1Q99K01 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdxdc1Q99K01 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdxdc1Q99K01 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdxdc1Q99K01 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdxdc1Q99K01 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdxdc1Q99K01 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdxdc1Q99K01 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdxdc1Q99K01 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdxdc1Q99K01 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdxdc1Q99K01 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdxdc1Q99K01 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdxdc1Q99K01 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdxdc1Q99K01 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdxdc1Q99K01 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdxdc1Q99K01 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdxdc1Q99K01 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdxdc1Q99K01 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Pdxdc1Q99K01 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdxdc1Q99K01 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdxdc1Q99K01 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdxdc1Q99K01 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdxdc1Q99K01 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdxdc1Q99K01 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdxdc1Q99K01 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdxdc1Q99K01 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdxdc1Q99K01 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdxdc1Q99K01 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pdxdc1Q99K01 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pdxdc1Q99K01 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pdxdc1Q99K01 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdxdc1Q99K01 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdxdc1Q99K01 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdxdc1Q99K01 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdxdc1Q99K01 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdxdc1Q99K01 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms