Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR6

Nmnat3, Nicotinamide/nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmnat3Q99JR6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nmnat3Q99JR6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nmnat3Q99JR6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nmnat3Q99JR6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nmnat3Q99JR6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nmnat3Q99JR6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nmnat3Q99JR6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nmnat3Q99JR6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nmnat3Q99JR6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nmnat3Q99JR6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Nmnat3Q99JR6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nmnat3Q99JR6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nmnat3Q99JR6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nmnat3Q99JR6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Nmnat3Q99JR6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nmnat3Q99JR6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nmnat3Q99JR6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nmnat3Q99JR6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nmnat3Q99JR6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nmnat3Q99JR6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nmnat3Q99JR6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nmnat3Q99JR6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nmnat3Q99JR6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nmnat3Q99JR6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Nmnat3Q99JR6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nmnat3Q99JR6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nmnat3Q99JR6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nmnat3Q99JR6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nmnat3Q99JR6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nmnat3Q99JR6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nmnat3Q99JR6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nmnat3Q99JR6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nmnat3Q99JR6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nmnat3Q99JR6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nmnat3Q99JR6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nmnat3Q99JR6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nmnat3Q99JR6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nmnat3Q99JR6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nmnat3Q99JR6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nmnat3Q99JR6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nmnat3Q99JR6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nmnat3Q99JR6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nmnat3Q99JR6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nmnat3Q99JR6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nmnat3Q99JR6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nmnat3Q99JR6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nmnat3Q99JR6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nmnat3Q99JR6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nmnat3Q99JR6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nmnat3Q99JR6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nmnat3Q99JR6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nmnat3Q99JR6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nmnat3Q99JR6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nmnat3Q99JR6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nmnat3Q99JR6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nmnat3Q99JR6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nmnat3Q99JR6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nmnat3Q99JR6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nmnat3Q99JR6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nmnat3Q99JR6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nmnat3Q99JR6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nmnat3Q99JR6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nmnat3Q99JR6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nmnat3Q99JR6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nmnat3Q99JR6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nmnat3Q99JR6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nmnat3Q99JR6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nmnat3Q99JR6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nmnat3Q99JR6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nmnat3Q99JR6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nmnat3Q99JR6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nmnat3Q99JR6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nmnat3Q99JR6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nmnat3Q99JR6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nmnat3Q99JR6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nmnat3Q99JR6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nmnat3Q99JR6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nmnat3Q99JR6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nmnat3Q99JR6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nmnat3Q99JR6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nmnat3Q99JR6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nmnat3Q99JR6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nmnat3Q99JR6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nmnat3Q99JR6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nmnat3Q99JR6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nmnat3Q99JR6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nmnat3Q99JR6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nmnat3Q99JR6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nmnat3Q99JR6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nmnat3Q99JR6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nmnat3Q99JR6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nmnat3Q99JR6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nmnat3Q99JR6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nmnat3Q99JR6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nmnat3Q99JR6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nmnat3Q99JR6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nmnat3Q99JR6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nmnat3Q99JR6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nmnat3Q99JR6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nmnat3Q99JR6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms