Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttc30a1Q99J38 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttc30a1Q99J38 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc30a1Q99J38 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc30a1Q99J38 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc30a1Q99J38 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttc30a1Q99J38 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttc30a1Q99J38 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc30a1Q99J38 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc30a1Q99J38 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc30a1Q99J38 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc30a1Q99J38 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc30a1Q99J38 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc30a1Q99J38 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc30a1Q99J38 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc30a1Q99J38 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc30a1Q99J38 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc30a1Q99J38 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc30a1Q99J38 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc30a1Q99J38 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc30a1Q99J38 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc30a1Q99J38 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc30a1Q99J38 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc30a1Q99J38 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc30a1Q99J38 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc30a1Q99J38 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc30a1Q99J38 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc30a1Q99J38 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc30a1Q99J38 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc30a1Q99J38 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc30a1Q99J38 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc30a1Q99J38 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc30a1Q99J38 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc30a1Q99J38 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc30a1Q99J38 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc30a1Q99J38 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc30a1Q99J38 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc30a1Q99J38 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc30a1Q99J38 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc30a1Q99J38 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc30a1Q99J38 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttc30a1Q99J38 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc30a1Q99J38 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc30a1Q99J38 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttc30a1Q99J38 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc30a1Q99J38 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc30a1Q99J38 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc30a1Q99J38 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc30a1Q99J38 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc30a1Q99J38 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc30a1Q99J38 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc30a1Q99J38 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc30a1Q99J38 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc30a1Q99J38 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc30a1Q99J38 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc30a1Q99J38 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc30a1Q99J38 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc30a1Q99J38 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc30a1Q99J38 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc30a1Q99J38 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc30a1Q99J38 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc30a1Q99J38 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc30a1Q99J38 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc30a1Q99J38 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc30a1Q99J38 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc30a1Q99J38 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc30a1Q99J38 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc30a1Q99J38 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc30a1Q99J38 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc30a1Q99J38 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc30a1Q99J38 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc30a1Q99J38 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc30a1Q99J38 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc30a1Q99J38 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc30a1Q99J38 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc30a1Q99J38 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc30a1Q99J38 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc30a1Q99J38 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc30a1Q99J38 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc30a1Q99J38 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc30a1Q99J38 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc30a1Q99J38 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc30a1Q99J38 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc30a1Q99J38 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc30a1Q99J38 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ttc30a1Q99J38 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ttc30a1Q99J38 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ttc30a1Q99J38 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc30a1Q99J38 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc30a1Q99J38 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc30a1Q99J38 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc30a1Q99J38 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc30a1Q99J38 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc30a1Q99J38 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc30a1Q99J38 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc30a1Q99J38 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc30a1Q99J38 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc30a1Q99J38 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc30a1Q99J38 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc30a1Q99J38 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms