Protein–RNA interactions for Protein: Q922H2

Pdk3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdk3Q922H2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdk3Q922H2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdk3Q922H2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdk3Q922H2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdk3Q922H2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdk3Q922H2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdk3Q922H2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdk3Q922H2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdk3Q922H2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdk3Q922H2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdk3Q922H2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdk3Q922H2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdk3Q922H2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdk3Q922H2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pdk3Q922H2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdk3Q922H2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdk3Q922H2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdk3Q922H2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdk3Q922H2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdk3Q922H2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdk3Q922H2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdk3Q922H2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdk3Q922H2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdk3Q922H2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdk3Q922H2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdk3Q922H2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdk3Q922H2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdk3Q922H2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdk3Q922H2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pdk3Q922H2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdk3Q922H2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdk3Q922H2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdk3Q922H2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdk3Q922H2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdk3Q922H2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdk3Q922H2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdk3Q922H2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdk3Q922H2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdk3Q922H2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdk3Q922H2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdk3Q922H2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdk3Q922H2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdk3Q922H2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdk3Q922H2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdk3Q922H2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdk3Q922H2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdk3Q922H2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdk3Q922H2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdk3Q922H2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdk3Q922H2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdk3Q922H2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdk3Q922H2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdk3Q922H2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdk3Q922H2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdk3Q922H2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdk3Q922H2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdk3Q922H2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdk3Q922H2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdk3Q922H2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdk3Q922H2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdk3Q922H2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdk3Q922H2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdk3Q922H2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdk3Q922H2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdk3Q922H2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdk3Q922H2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdk3Q922H2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdk3Q922H2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pdk3Q922H2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdk3Q922H2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdk3Q922H2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdk3Q922H2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdk3Q922H2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdk3Q922H2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdk3Q922H2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdk3Q922H2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdk3Q922H2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdk3Q922H2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdk3Q922H2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdk3Q922H2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdk3Q922H2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdk3Q922H2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdk3Q922H2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdk3Q922H2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdk3Q922H2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdk3Q922H2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pdk3Q922H2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdk3Q922H2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdk3Q922H2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdk3Q922H2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdk3Q922H2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdk3Q922H2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdk3Q922H2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdk3Q922H2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdk3Q922H2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdk3Q922H2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdk3Q922H2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdk3Q922H2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdk3Q922H2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdk3Q922H2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms