Protein–RNA interactions for Protein: Q920E5

Fdps, Farnesyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FdpsQ920E5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FdpsQ920E5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FdpsQ920E5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FdpsQ920E5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FdpsQ920E5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FdpsQ920E5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FdpsQ920E5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FdpsQ920E5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FdpsQ920E5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FdpsQ920E5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FdpsQ920E5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FdpsQ920E5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FdpsQ920E5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FdpsQ920E5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FdpsQ920E5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FdpsQ920E5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FdpsQ920E5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FdpsQ920E5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FdpsQ920E5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FdpsQ920E5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FdpsQ920E5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FdpsQ920E5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FdpsQ920E5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FdpsQ920E5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FdpsQ920E5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FdpsQ920E5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FdpsQ920E5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FdpsQ920E5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FdpsQ920E5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FdpsQ920E5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FdpsQ920E5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FdpsQ920E5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FdpsQ920E5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FdpsQ920E5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FdpsQ920E5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FdpsQ920E5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FdpsQ920E5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FdpsQ920E5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FdpsQ920E5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FdpsQ920E5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FdpsQ920E5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FdpsQ920E5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FdpsQ920E5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FdpsQ920E5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FdpsQ920E5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FdpsQ920E5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FdpsQ920E5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FdpsQ920E5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FdpsQ920E5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FdpsQ920E5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FdpsQ920E5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FdpsQ920E5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FdpsQ920E5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FdpsQ920E5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FdpsQ920E5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
FdpsQ920E5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FdpsQ920E5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FdpsQ920E5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FdpsQ920E5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FdpsQ920E5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FdpsQ920E5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FdpsQ920E5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FdpsQ920E5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FdpsQ920E5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FdpsQ920E5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FdpsQ920E5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FdpsQ920E5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FdpsQ920E5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FdpsQ920E5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FdpsQ920E5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FdpsQ920E5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FdpsQ920E5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FdpsQ920E5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FdpsQ920E5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FdpsQ920E5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FdpsQ920E5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FdpsQ920E5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FdpsQ920E5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FdpsQ920E5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FdpsQ920E5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FdpsQ920E5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FdpsQ920E5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FdpsQ920E5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FdpsQ920E5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FdpsQ920E5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FdpsQ920E5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FdpsQ920E5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FdpsQ920E5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
FdpsQ920E5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FdpsQ920E5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FdpsQ920E5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FdpsQ920E5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FdpsQ920E5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FdpsQ920E5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FdpsQ920E5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FdpsQ920E5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FdpsQ920E5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FdpsQ920E5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FdpsQ920E5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FdpsQ920E5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms