Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx11Q91WL6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx11Q91WL6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx11Q91WL6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx11Q91WL6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx11Q91WL6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx11Q91WL6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx11Q91WL6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx11Q91WL6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx11Q91WL6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx11Q91WL6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Snx11Q91WL6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx11Q91WL6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx11Q91WL6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx11Q91WL6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx11Q91WL6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx11Q91WL6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx11Q91WL6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx11Q91WL6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx11Q91WL6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx11Q91WL6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx11Q91WL6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snx11Q91WL6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snx11Q91WL6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx11Q91WL6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx11Q91WL6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx11Q91WL6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx11Q91WL6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx11Q91WL6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx11Q91WL6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx11Q91WL6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx11Q91WL6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx11Q91WL6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx11Q91WL6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx11Q91WL6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx11Q91WL6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx11Q91WL6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx11Q91WL6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx11Q91WL6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx11Q91WL6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx11Q91WL6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx11Q91WL6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx11Q91WL6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx11Q91WL6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx11Q91WL6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx11Q91WL6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx11Q91WL6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx11Q91WL6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx11Q91WL6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx11Q91WL6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx11Q91WL6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx11Q91WL6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx11Q91WL6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx11Q91WL6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx11Q91WL6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx11Q91WL6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx11Q91WL6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx11Q91WL6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx11Q91WL6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx11Q91WL6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx11Q91WL6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx11Q91WL6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx11Q91WL6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx11Q91WL6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx11Q91WL6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx11Q91WL6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx11Q91WL6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx11Q91WL6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx11Q91WL6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx11Q91WL6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx11Q91WL6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx11Q91WL6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx11Q91WL6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx11Q91WL6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx11Q91WL6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx11Q91WL6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx11Q91WL6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx11Q91WL6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx11Q91WL6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx11Q91WL6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx11Q91WL6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx11Q91WL6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx11Q91WL6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx11Q91WL6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx11Q91WL6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx11Q91WL6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx11Q91WL6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx11Q91WL6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx11Q91WL6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx11Q91WL6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx11Q91WL6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx11Q91WL6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx11Q91WL6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx11Q91WL6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx11Q91WL6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx11Q91WL6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx11Q91WL6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx11Q91WL6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx11Q91WL6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx11Q91WL6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms