Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp3Q91W36 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp3Q91W36 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp3Q91W36 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp3Q91W36 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp3Q91W36 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp3Q91W36 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp3Q91W36 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp3Q91W36 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp3Q91W36 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp3Q91W36 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp3Q91W36 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp3Q91W36 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp3Q91W36 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp3Q91W36 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp3Q91W36 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp3Q91W36 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp3Q91W36 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp3Q91W36 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp3Q91W36 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp3Q91W36 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp3Q91W36 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp3Q91W36 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp3Q91W36 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Usp3Q91W36 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Usp3Q91W36 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp3Q91W36 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp3Q91W36 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp3Q91W36 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp3Q91W36 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp3Q91W36 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp3Q91W36 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp3Q91W36 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp3Q91W36 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp3Q91W36 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp3Q91W36 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp3Q91W36 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp3Q91W36 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp3Q91W36 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp3Q91W36 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp3Q91W36 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp3Q91W36 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp3Q91W36 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp3Q91W36 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp3Q91W36 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp3Q91W36 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp3Q91W36 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp3Q91W36 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp3Q91W36 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp3Q91W36 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp3Q91W36 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp3Q91W36 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp3Q91W36 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp3Q91W36 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp3Q91W36 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp3Q91W36 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp3Q91W36 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp3Q91W36 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp3Q91W36 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp3Q91W36 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp3Q91W36 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp3Q91W36 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp3Q91W36 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp3Q91W36 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp3Q91W36 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp3Q91W36 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp3Q91W36 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp3Q91W36 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp3Q91W36 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp3Q91W36 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp3Q91W36 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp3Q91W36 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp3Q91W36 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp3Q91W36 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp3Q91W36 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp3Q91W36 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp3Q91W36 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp3Q91W36 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp3Q91W36 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp3Q91W36 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp3Q91W36 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp3Q91W36 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Usp3Q91W36 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp3Q91W36 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp3Q91W36 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp3Q91W36 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp3Q91W36 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp3Q91W36 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp3Q91W36 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp3Q91W36 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp3Q91W36 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp3Q91W36 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp3Q91W36 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp3Q91W36 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp3Q91W36 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp3Q91W36 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp3Q91W36 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp3Q91W36 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp3Q91W36 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp3Q91W36 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms