Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bgrl3Q91VW3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bgrl3Q91VW3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms