Protein–RNA interactions for Protein: Q91VR8

Brk1, Protein BRICK1, mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brk1Q91VR8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brk1Q91VR8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brk1Q91VR8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brk1Q91VR8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brk1Q91VR8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brk1Q91VR8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brk1Q91VR8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brk1Q91VR8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brk1Q91VR8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brk1Q91VR8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brk1Q91VR8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brk1Q91VR8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brk1Q91VR8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brk1Q91VR8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brk1Q91VR8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brk1Q91VR8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brk1Q91VR8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brk1Q91VR8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brk1Q91VR8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brk1Q91VR8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brk1Q91VR8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brk1Q91VR8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brk1Q91VR8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brk1Q91VR8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brk1Q91VR8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brk1Q91VR8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brk1Q91VR8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brk1Q91VR8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brk1Q91VR8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brk1Q91VR8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brk1Q91VR8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brk1Q91VR8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brk1Q91VR8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brk1Q91VR8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brk1Q91VR8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brk1Q91VR8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brk1Q91VR8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brk1Q91VR8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brk1Q91VR8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brk1Q91VR8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brk1Q91VR8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brk1Q91VR8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brk1Q91VR8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brk1Q91VR8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Brk1Q91VR8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brk1Q91VR8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brk1Q91VR8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brk1Q91VR8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brk1Q91VR8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brk1Q91VR8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brk1Q91VR8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brk1Q91VR8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brk1Q91VR8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brk1Q91VR8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brk1Q91VR8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brk1Q91VR8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brk1Q91VR8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brk1Q91VR8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brk1Q91VR8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brk1Q91VR8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brk1Q91VR8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brk1Q91VR8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brk1Q91VR8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brk1Q91VR8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brk1Q91VR8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brk1Q91VR8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brk1Q91VR8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brk1Q91VR8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brk1Q91VR8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brk1Q91VR8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brk1Q91VR8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brk1Q91VR8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Brk1Q91VR8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brk1Q91VR8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brk1Q91VR8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brk1Q91VR8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brk1Q91VR8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brk1Q91VR8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brk1Q91VR8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brk1Q91VR8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brk1Q91VR8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brk1Q91VR8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brk1Q91VR8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brk1Q91VR8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brk1Q91VR8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brk1Q91VR8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brk1Q91VR8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brk1Q91VR8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brk1Q91VR8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brk1Q91VR8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brk1Q91VR8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brk1Q91VR8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brk1Q91VR8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brk1Q91VR8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brk1Q91VR8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brk1Q91VR8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brk1Q91VR8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brk1Q91VR8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brk1Q91VR8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brk1Q91VR8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms