Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW3

Cacng6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng6Q8VHW3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacng6Q8VHW3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacng6Q8VHW3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacng6Q8VHW3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacng6Q8VHW3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacng6Q8VHW3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacng6Q8VHW3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacng6Q8VHW3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cacng6Q8VHW3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacng6Q8VHW3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacng6Q8VHW3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacng6Q8VHW3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacng6Q8VHW3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacng6Q8VHW3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacng6Q8VHW3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacng6Q8VHW3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacng6Q8VHW3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacng6Q8VHW3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacng6Q8VHW3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacng6Q8VHW3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacng6Q8VHW3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacng6Q8VHW3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacng6Q8VHW3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacng6Q8VHW3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacng6Q8VHW3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacng6Q8VHW3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacng6Q8VHW3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacng6Q8VHW3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacng6Q8VHW3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacng6Q8VHW3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacng6Q8VHW3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacng6Q8VHW3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacng6Q8VHW3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacng6Q8VHW3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacng6Q8VHW3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacng6Q8VHW3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacng6Q8VHW3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cacng6Q8VHW3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacng6Q8VHW3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacng6Q8VHW3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacng6Q8VHW3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacng6Q8VHW3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacng6Q8VHW3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacng6Q8VHW3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacng6Q8VHW3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacng6Q8VHW3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacng6Q8VHW3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacng6Q8VHW3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacng6Q8VHW3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacng6Q8VHW3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacng6Q8VHW3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacng6Q8VHW3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacng6Q8VHW3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacng6Q8VHW3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacng6Q8VHW3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacng6Q8VHW3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacng6Q8VHW3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacng6Q8VHW3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacng6Q8VHW3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacng6Q8VHW3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacng6Q8VHW3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacng6Q8VHW3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacng6Q8VHW3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacng6Q8VHW3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacng6Q8VHW3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacng6Q8VHW3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacng6Q8VHW3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacng6Q8VHW3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacng6Q8VHW3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacng6Q8VHW3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacng6Q8VHW3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacng6Q8VHW3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacng6Q8VHW3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacng6Q8VHW3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacng6Q8VHW3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacng6Q8VHW3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacng6Q8VHW3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacng6Q8VHW3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacng6Q8VHW3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacng6Q8VHW3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacng6Q8VHW3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacng6Q8VHW3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacng6Q8VHW3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cacng6Q8VHW3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacng6Q8VHW3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacng6Q8VHW3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacng6Q8VHW3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacng6Q8VHW3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacng6Q8VHW3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacng6Q8VHW3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacng6Q8VHW3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacng6Q8VHW3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacng6Q8VHW3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacng6Q8VHW3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacng6Q8VHW3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacng6Q8VHW3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacng6Q8VHW3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacng6Q8VHW3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacng6Q8VHW3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacng6Q8VHW3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms