Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SelenomQ8VHC3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SelenomQ8VHC3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SelenomQ8VHC3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SelenomQ8VHC3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SelenomQ8VHC3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SelenomQ8VHC3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SelenomQ8VHC3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SelenomQ8VHC3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SelenomQ8VHC3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SelenomQ8VHC3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SelenomQ8VHC3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SelenomQ8VHC3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SelenomQ8VHC3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SelenomQ8VHC3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SelenomQ8VHC3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SelenomQ8VHC3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SelenomQ8VHC3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SelenomQ8VHC3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SelenomQ8VHC3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SelenomQ8VHC3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SelenomQ8VHC3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SelenomQ8VHC3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SelenomQ8VHC3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SelenomQ8VHC3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SelenomQ8VHC3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SelenomQ8VHC3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SelenomQ8VHC3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SelenomQ8VHC3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SelenomQ8VHC3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SelenomQ8VHC3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SelenomQ8VHC3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SelenomQ8VHC3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SelenomQ8VHC3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SelenomQ8VHC3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SelenomQ8VHC3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SelenomQ8VHC3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SelenomQ8VHC3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SelenomQ8VHC3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SelenomQ8VHC3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SelenomQ8VHC3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SelenomQ8VHC3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SelenomQ8VHC3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SelenomQ8VHC3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SelenomQ8VHC3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SelenomQ8VHC3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SelenomQ8VHC3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SelenomQ8VHC3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SelenomQ8VHC3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SelenomQ8VHC3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SelenomQ8VHC3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SelenomQ8VHC3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SelenomQ8VHC3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SelenomQ8VHC3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SelenomQ8VHC3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SelenomQ8VHC3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SelenomQ8VHC3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SelenomQ8VHC3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SelenomQ8VHC3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SelenomQ8VHC3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SelenomQ8VHC3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SelenomQ8VHC3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SelenomQ8VHC3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SelenomQ8VHC3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SelenomQ8VHC3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SelenomQ8VHC3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SelenomQ8VHC3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SelenomQ8VHC3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SelenomQ8VHC3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SelenomQ8VHC3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SelenomQ8VHC3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SelenomQ8VHC3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SelenomQ8VHC3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SelenomQ8VHC3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SelenomQ8VHC3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SelenomQ8VHC3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SelenomQ8VHC3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SelenomQ8VHC3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SelenomQ8VHC3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SelenomQ8VHC3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SelenomQ8VHC3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SelenomQ8VHC3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SelenomQ8VHC3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SelenomQ8VHC3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SelenomQ8VHC3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SelenomQ8VHC3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SelenomQ8VHC3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SelenomQ8VHC3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SelenomQ8VHC3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SelenomQ8VHC3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SelenomQ8VHC3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SelenomQ8VHC3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SelenomQ8VHC3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SelenomQ8VHC3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SelenomQ8VHC3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SelenomQ8VHC3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SelenomQ8VHC3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SelenomQ8VHC3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SelenomQ8VHC3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SelenomQ8VHC3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms