Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED2

Bloc1s4, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bloc1s4Q8VED2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Bloc1s4Q8VED2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Bloc1s4Q8VED2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Bloc1s4Q8VED2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Bloc1s4Q8VED2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Bloc1s4Q8VED2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Bloc1s4Q8VED2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Bloc1s4Q8VED2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Bloc1s4Q8VED2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Bloc1s4Q8VED2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Bloc1s4Q8VED2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Bloc1s4Q8VED2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Bloc1s4Q8VED2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Bloc1s4Q8VED2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Bloc1s4Q8VED2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Bloc1s4Q8VED2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Bloc1s4Q8VED2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,51■■■□□ 2,31
Bloc1s4Q8VED2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29,51■■■□□ 2,31
Bloc1s4Q8VED2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Bloc1s4Q8VED2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Bloc1s4Q8VED2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Bloc1s4Q8VED2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Bloc1s4Q8VED2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29,48■■■□□ 2,31
Bloc1s4Q8VED2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Bloc1s4Q8VED2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Bloc1s4Q8VED2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Bloc1s4Q8VED2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Bloc1s4Q8VED2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,45■■■□□ 2,31
Bloc1s4Q8VED2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Bloc1s4Q8VED2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29,44■■■□□ 2,3
Bloc1s4Q8VED2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Bloc1s4Q8VED2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Bloc1s4Q8VED2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Bloc1s4Q8VED2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Bloc1s4Q8VED2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Bloc1s4Q8VED2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Bloc1s4Q8VED2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Bloc1s4Q8VED2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,29
Bloc1s4Q8VED2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Bloc1s4Q8VED2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Bloc1s4Q8VED2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Bloc1s4Q8VED2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Bloc1s4Q8VED2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Bloc1s4Q8VED2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Bloc1s4Q8VED2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Bloc1s4Q8VED2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29,33■■■□□ 2,29
Bloc1s4Q8VED2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,33■■■□□ 2,29
Bloc1s4Q8VED2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Bloc1s4Q8VED2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Bloc1s4Q8VED2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Bloc1s4Q8VED2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Bloc1s4Q8VED2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29,3■■■□□ 2,28
Bloc1s4Q8VED2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Bloc1s4Q8VED2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Bloc1s4Q8VED2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Bloc1s4Q8VED2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Bloc1s4Q8VED2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Bloc1s4Q8VED2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Bloc1s4Q8VED2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29,27■■■□□ 2,28
Bloc1s4Q8VED2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Bloc1s4Q8VED2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Bloc1s4Q8VED2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Bloc1s4Q8VED2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,24■■■□□ 2,27
Bloc1s4Q8VED2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Bloc1s4Q8VED2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Bloc1s4Q8VED2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Bloc1s4Q8VED2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Bloc1s4Q8VED2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Bloc1s4Q8VED2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Bloc1s4Q8VED2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Bloc1s4Q8VED2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Bloc1s4Q8VED2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Bloc1s4Q8VED2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Bloc1s4Q8VED2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Bloc1s4Q8VED2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Bloc1s4Q8VED2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Bloc1s4Q8VED2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Bloc1s4Q8VED2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Bloc1s4Q8VED2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Bloc1s4Q8VED2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Bloc1s4Q8VED2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Bloc1s4Q8VED2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Bloc1s4Q8VED2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Bloc1s4Q8VED2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Bloc1s4Q8VED2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29,1■■■□□ 2,25
Bloc1s4Q8VED2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Bloc1s4Q8VED2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Bloc1s4Q8VED2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Bloc1s4Q8VED2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29,08■■■□□ 2,25
Bloc1s4Q8VED2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29,07■■■□□ 2,24
Bloc1s4Q8VED2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Bloc1s4Q8VED2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Bloc1s4Q8VED2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Bloc1s4Q8VED2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Bloc1s4Q8VED2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Bloc1s4Q8VED2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Bloc1s4Q8VED2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Bloc1s4Q8VED2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Bloc1s4Q8VED2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Bloc1s4Q8VED2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms