Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stx18Q8VDS8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stx18Q8VDS8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stx18Q8VDS8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stx18Q8VDS8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stx18Q8VDS8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stx18Q8VDS8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stx18Q8VDS8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stx18Q8VDS8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stx18Q8VDS8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stx18Q8VDS8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stx18Q8VDS8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stx18Q8VDS8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx18Q8VDS8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stx18Q8VDS8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stx18Q8VDS8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx18Q8VDS8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stx18Q8VDS8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stx18Q8VDS8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stx18Q8VDS8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Stx18Q8VDS8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stx18Q8VDS8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Stx18Q8VDS8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx18Q8VDS8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx18Q8VDS8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx18Q8VDS8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Stx18Q8VDS8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx18Q8VDS8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stx18Q8VDS8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx18Q8VDS8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx18Q8VDS8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stx18Q8VDS8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stx18Q8VDS8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Stx18Q8VDS8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stx18Q8VDS8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx18Q8VDS8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx18Q8VDS8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stx18Q8VDS8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stx18Q8VDS8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stx18Q8VDS8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stx18Q8VDS8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stx18Q8VDS8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stx18Q8VDS8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stx18Q8VDS8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stx18Q8VDS8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx18Q8VDS8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx18Q8VDS8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx18Q8VDS8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx18Q8VDS8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx18Q8VDS8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx18Q8VDS8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stx18Q8VDS8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stx18Q8VDS8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stx18Q8VDS8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stx18Q8VDS8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stx18Q8VDS8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stx18Q8VDS8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stx18Q8VDS8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stx18Q8VDS8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stx18Q8VDS8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stx18Q8VDS8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stx18Q8VDS8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stx18Q8VDS8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stx18Q8VDS8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stx18Q8VDS8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Stx18Q8VDS8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Stx18Q8VDS8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stx18Q8VDS8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stx18Q8VDS8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx18Q8VDS8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx18Q8VDS8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx18Q8VDS8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx18Q8VDS8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx18Q8VDS8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx18Q8VDS8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx18Q8VDS8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx18Q8VDS8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx18Q8VDS8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx18Q8VDS8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx18Q8VDS8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx18Q8VDS8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Stx18Q8VDS8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stx18Q8VDS8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx18Q8VDS8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx18Q8VDS8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx18Q8VDS8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx18Q8VDS8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx18Q8VDS8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stx18Q8VDS8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx18Q8VDS8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx18Q8VDS8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx18Q8VDS8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx18Q8VDS8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx18Q8VDS8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx18Q8VDS8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx18Q8VDS8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stx18Q8VDS8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Stx18Q8VDS8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stx18Q8VDS8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx18Q8VDS8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms