Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCY6

Utp6, U3 small nucleolar RNA-associated protein 6 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp6Q8VCY6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Utp6Q8VCY6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Utp6Q8VCY6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Utp6Q8VCY6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Utp6Q8VCY6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Utp6Q8VCY6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Utp6Q8VCY6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Utp6Q8VCY6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Utp6Q8VCY6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Utp6Q8VCY6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Utp6Q8VCY6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Utp6Q8VCY6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Utp6Q8VCY6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Utp6Q8VCY6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Utp6Q8VCY6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Utp6Q8VCY6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Utp6Q8VCY6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Utp6Q8VCY6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Utp6Q8VCY6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Utp6Q8VCY6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Utp6Q8VCY6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Utp6Q8VCY6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Utp6Q8VCY6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Utp6Q8VCY6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Utp6Q8VCY6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Utp6Q8VCY6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Utp6Q8VCY6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Utp6Q8VCY6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Utp6Q8VCY6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Utp6Q8VCY6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Utp6Q8VCY6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Utp6Q8VCY6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Utp6Q8VCY6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Utp6Q8VCY6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Utp6Q8VCY6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Utp6Q8VCY6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Utp6Q8VCY6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Utp6Q8VCY6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Utp6Q8VCY6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Utp6Q8VCY6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Utp6Q8VCY6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Utp6Q8VCY6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Utp6Q8VCY6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Utp6Q8VCY6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Utp6Q8VCY6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Utp6Q8VCY6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Utp6Q8VCY6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Utp6Q8VCY6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Utp6Q8VCY6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Utp6Q8VCY6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Utp6Q8VCY6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Utp6Q8VCY6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Utp6Q8VCY6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Utp6Q8VCY6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Utp6Q8VCY6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Utp6Q8VCY6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Utp6Q8VCY6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Utp6Q8VCY6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Utp6Q8VCY6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Utp6Q8VCY6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Utp6Q8VCY6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Utp6Q8VCY6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Utp6Q8VCY6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Utp6Q8VCY6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Utp6Q8VCY6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Utp6Q8VCY6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Utp6Q8VCY6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Utp6Q8VCY6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Utp6Q8VCY6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Utp6Q8VCY6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Utp6Q8VCY6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Utp6Q8VCY6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Utp6Q8VCY6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Utp6Q8VCY6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Utp6Q8VCY6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Utp6Q8VCY6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Utp6Q8VCY6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Utp6Q8VCY6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Utp6Q8VCY6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Utp6Q8VCY6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Utp6Q8VCY6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Utp6Q8VCY6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Utp6Q8VCY6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Utp6Q8VCY6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Utp6Q8VCY6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Utp6Q8VCY6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Utp6Q8VCY6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Utp6Q8VCY6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Utp6Q8VCY6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Utp6Q8VCY6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Utp6Q8VCY6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Utp6Q8VCY6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Utp6Q8VCY6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Utp6Q8VCY6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Utp6Q8VCY6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Utp6Q8VCY6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Utp6Q8VCY6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Utp6Q8VCY6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Utp6Q8VCY6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Utp6Q8VCY6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms